More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_B3756 on replicon NC_007349
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007349  Mbar_B3756  transposase  100 
 
 		 93 aa  189  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.807636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2695  transposase  95.7 
 
 		 93 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.185227  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2883  transposase  93.55 
 
 		 105 aa  178  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.467748  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3700  transposase  91.4 
 
 		 134 aa  174  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00073433  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1655  transposase  83.87 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2592  transposase  82.8 
 
 		 134 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319874  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3239  transposase  92.75 
 
 		 69 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.283293  normal  0.111466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1017  transposase  89.13 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3048  transposase  88.37 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00273884  normal  0.555878 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0625  ISCpe2, transposase orfA  41.3 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274622  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0406  ISCpe2, transposase orfA  40.22 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  40.22 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0678  ISCpe2, transposase orfA  40.22 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0571  transposase IS200-family protein  34.48 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  39.13 
 
 		 187 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1776  hypothetical protein  37.63 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208218 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  39.13 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1768  hypothetical protein  37.63 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.3207 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  39.13 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  39.13 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  39.13 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2799  transposase IS200-family protein  33.71 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1431  transposase IS200-family protein  33.71 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0173  transposase IS200-family protein  33.71 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406175 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  35.87 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1731  hypothetical protein  36.56 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1740  hypothetical protein  36.56 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.431395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1907  hypothetical protein  36.56 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1829  hypothetical protein  36.56 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.615719 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1732  hypothetical protein  36.56 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0866  hypothetical protein  36.56 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.291609 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1291  transposase IS200-family protein  36.56 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.254589  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1416  transposase IS200-family protein  36.56 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0553663  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  31.46 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  32.22 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  31.52 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  33.33 
 
 		 315 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  36.47 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  37.08 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0393  transposase IS200-family protein  31.11 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1248  hypothetical protein  34.07 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2521  hypothetical protein  34.07 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167581  normal  0.919891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2723  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  32.61 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3734  hypothetical protein  34.07 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.231376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  34.83 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2405  transposase IS200-family protein  32.26 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.585077  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  39.76 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3107  hypothetical protein  32.97 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563963  normal  0.438029 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  33.71 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  36.59 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  36.59 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  36.59 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3079  transposase IS200-family protein  28.57 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.396516  normal  0.172038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  31.46 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  35.71 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  35.71 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  35.71 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  35.71 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  35.71 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  35.71 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  36.59 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  36.59 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  36.59 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  36.59 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  36.59 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  30.34 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  35.63 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  36.59 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  30.34 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  36.67 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0881  transposase  33.33 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0017451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3832  transposase IS200-family protein  36.59 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0101  transposase IS200  28.26 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4667  transposase  31.11 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  35.37 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2126  transposase IS200-family protein  32.58 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3913  transposase IS200-family protein  32.58 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0368355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3938  transposase IS200-family protein  32.58 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00130774  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3237  IS200 transposase orfA  30.77 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2638  transposase  32.56 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00248173  normal  0.153291 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  34.52 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1682  transposase IS200-family protein  35.8 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1878  transposase IS200-family protein  27.66 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  31.52 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0445  transposase  30.43 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.713424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0631  transposase  30.43 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0653  transposase  30.68 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1189  transposase  30.43 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2595  transposase  30.43 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0602972  normal  0.532476 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0382  IS1469, transposase  40.74 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  36.67 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  26.67 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  29.21 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  34.15 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  34.15 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  34.15 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  34.15 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  34.15 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>