More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3048 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3048  transposase  100 
 
 
84 aa  167  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00273884  normal  0.555878 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3700  transposase  94.05 
 
 
134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00073433  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1655  transposase  84.52 
 
 
134 aa  144  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2592  transposase  82.14 
 
 
134 aa  140  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319874  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1017  transposase  75 
 
 
77 aa  111  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3240  transposase  82.81 
 
 
64 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.408915  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2883  transposase  95.35 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.467748  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2695  transposase  90.7 
 
 
93 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.185227  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3756  transposase  88.37 
 
 
93 aa  77  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.807636  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  45.07 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  45.07 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  45.07 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  45.07 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  45.07 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  42.25 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  43.66 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  38.1 
 
 
138 aa  60.1  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1291  transposase IS200-family protein  38.16 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.254589  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1416  transposase IS200-family protein  38.16 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0553663  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  43.24 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  40.51 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2706  transposase IS200-family protein  41.25 
 
 
135 aa  58.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000307222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3803  transposase IS200-family protein  39.74 
 
 
134 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0900  transposase IS200-family protein  39.74 
 
 
134 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  hitchhiker  0.000000040473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4295  transposase IS200-family protein  37.18 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000924983  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  39.51 
 
 
158 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  38.81 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2799  transposase IS200-family protein  32.94 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0173  transposase IS200-family protein  32.94 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1431  transposase IS200-family protein  32.94 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0189  transposase IS200-family protein  37.88 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  35.14 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  38.27 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2179  transposase IS200-family protein  37.88 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.258783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3001  transposase IS200-family protein  37.88 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000296892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2038  transposase IS200-family protein  37.88 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2847  transposase IS200-family protein  37.88 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  40.54 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  36.9 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2322  transposase IS200-family protein  46.97 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2667  transposase IS200-family protein  46.97 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.370645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  36.9 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  36.9 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2830  transposase IS200-family protein  32.26 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  36.9 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  36.9 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  36.49 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  36.9 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  36.9 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1192  transposase IS200-family protein  38.46 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.541746  normal  0.0271846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3555  transposase IS200-family protein  38.46 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3851  transposase IS200-family protein  38.46 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0764343  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0456  transposase IS200-family protein  38.46 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.176435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0416  transposase IS200-family protein  38.46 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.179707  normal  0.0295664 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4105  transposase IS200-family protein  34.33 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1667  transposase IS200-family protein  36.49 
 
 
84 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.729393  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3079  transposase IS200-family protein  29.49 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.396516  normal  0.172038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2011  transposase IS200-family protein  40.91 
 
 
134 aa  53.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.206349  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0625  ISCpe2, transposase orfA  48 
 
 
105 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274622  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3227  transposase IS200-family protein  32.05 
 
 
130 aa  52.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0437  transposase IS200-family protein  39.19 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769962  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0406  ISCpe2, transposase orfA  48 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0678  ISCpe2, transposase orfA  48 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  31.25 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2126  transposase IS200-family protein  36 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3913  transposase IS200-family protein  36 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0368355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3938  transposase IS200-family protein  36 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00130774  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1129  transposase IS200-family protein  32.05 
 
 
130 aa  52.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  32.1 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  32.1 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1776  hypothetical protein  34.29 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208218 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0415  transposase IS200-family protein  39.19 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.313771 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0427  transposase IS200-family protein  39.19 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.465704  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3365  transposase IS200-family protein  29.85 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1248  hypothetical protein  35.9 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2521  hypothetical protein  35.9 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167581  normal  0.919891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3734  hypothetical protein  35.9 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.231376  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  32.88 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2929  transposase IS200-family protein  29.85 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  31.08 
 
 
175 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  32.5 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  32.43 
 
 
315 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3107  hypothetical protein  35.9 
 
 
149 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563963  normal  0.438029 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2405  transposase IS200-family protein  32.89 
 
 
147 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.585077  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  37.8 
 
 
133 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  31.25 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  31.25 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7258  transposase IS200-family protein  28.05 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113138  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  31.51 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  36.11 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1852  transposase IS200-family protein  34.78 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0725841  normal  0.0149515 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  31.51 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2962  transposase IS200-like  28.38 
 
 
171 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.343837  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1732  hypothetical protein  32.86 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  36.23 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  28.95 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4523  transposase IS200-family protein  31.25 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.998354  normal  0.81056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>