More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2883 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2883  transposase  100 
 
 
105 aa  212  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.467748  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2695  transposase  95.7 
 
 
93 aa  184  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.185227  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3700  transposase  93.55 
 
 
134 aa  179  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00073433  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3756  transposase  93.55 
 
 
93 aa  178  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.807636  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1655  transposase  86.02 
 
 
134 aa  168  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2592  transposase  84.95 
 
 
134 aa  166  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319874  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3239  transposase  91.3 
 
 
69 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.283293  normal  0.111466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1017  transposase  82.69 
 
 
77 aa  88.6  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3048  transposase  95.35 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00273884  normal  0.555878 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  43.16 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0625  ISCpe2, transposase orfA  43.48 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274622  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0406  ISCpe2, transposase orfA  42.39 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  42.11 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0678  ISCpe2, transposase orfA  42.39 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  42.11 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  42.11 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  42.11 
 
 
133 aa  76.6  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  42.11 
 
 
133 aa  76.6  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0571  transposase IS200-family protein  35.63 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2799  transposase IS200-family protein  32.58 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0173  transposase IS200-family protein  32.58 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1431  transposase IS200-family protein  32.58 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  35.87 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  39.33 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1768  hypothetical protein  36.56 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.3207 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  34.44 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1776  hypothetical protein  36.56 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  35.87 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  32.26 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  33.33 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  35.56 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  32.61 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1416  transposase IS200-family protein  36.17 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0553663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1829  hypothetical protein  35.48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.615719 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1740  hypothetical protein  35.48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.431395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1907  hypothetical protein  35.48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1291  transposase IS200-family protein  36.17 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.254589  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0866  hypothetical protein  35.48 
 
 
128 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.291609 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1731  hypothetical protein  35.48 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1732  hypothetical protein  35.48 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2723  transposase IS200-family protein  38.89 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2638  transposase  35.87 
 
 
155 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00248173  normal  0.153291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0881  transposase  35.79 
 
 
133 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0017451  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  38.89 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  41.94 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  35.96 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0445  transposase  34.78 
 
 
155 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.713424  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0631  transposase  34.78 
 
 
155 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1189  transposase  34.78 
 
 
155 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2595  transposase  34.78 
 
 
155 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0602972  normal  0.532476 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3079  transposase IS200-family protein  29.67 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.396516  normal  0.172038 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  37.8 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0653  transposase  35.23 
 
 
160 aa  60.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4667  transposase  35.56 
 
 
92 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  35.63 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  38.55 
 
 
142 aa  59.3  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  34.83 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0393  transposase IS200-family protein  31.71 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  35.63 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1878  transposase IS200-family protein  29.59 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  37.78 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  32.58 
 
 
138 aa  58.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1248  hypothetical protein  34.07 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2521  hypothetical protein  34.07 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167581  normal  0.919891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3734  hypothetical protein  34.07 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.231376  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  37.8 
 
 
151 aa  57.8  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1682  transposase IS200-family protein  34.83 
 
 
149 aa  57.4  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  35.71 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  35.71 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  35.71 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  35.71 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  35.71 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  35.71 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  30.53 
 
 
136 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  34.44 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2405  transposase IS200-family protein  32.26 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.585077  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3107  hypothetical protein  32.97 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563963  normal  0.438029 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  36.59 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  33.71 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  36.59 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  36.59 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4105  transposase IS200-family protein  32.22 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  36.59 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  35.37 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  33.71 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  33.71 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  33.71 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  33.71 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  33.71 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  33.71 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  33.71 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  33.71 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  33.71 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  33.71 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  33.71 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  33.71 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3237  IS200 transposase orfA  31.87 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  36.59 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  34.83 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>