24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3239 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3239  transposase  100 
 
 
69 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.283293  normal  0.111466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2695  transposase  94.2 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.185227  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3700  transposase  94.2 
 
 
134 aa  131  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00073433  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2883  transposase  91.3 
 
 
105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.467748  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3756  transposase  92.75 
 
 
93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.807636  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1655  transposase  86.96 
 
 
134 aa  123  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2592  transposase  86.96 
 
 
134 aa  122  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319874  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1017  transposase  87.1 
 
 
77 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0571  transposase IS200-family protein  32.31 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  38.24 
 
 
151 aa  47  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  33.82 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  30.88 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2723  transposase IS200-family protein  31.34 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0173  transposase IS200-family protein  27.94 
 
 
139 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1431  transposase IS200-family protein  27.94 
 
 
139 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2799  transposase IS200-family protein  27.94 
 
 
139 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695021 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1682  transposase IS200-family protein  35.29 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  29.41 
 
 
148 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0393  transposase IS200-family protein  29.41 
 
 
122 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0625  ISCpe2, transposase orfA  32.35 
 
 
105 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  32.35 
 
 
315 aa  40.8  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  33.33 
 
 
175 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  30.88 
 
 
187 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  30.88 
 
 
123 aa  40.4  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>