82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1010 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1010  transposase  100 
 
 		 146 aa  298  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0773  transposase  48.28 
 
 		 223 aa  153  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2901  transposase  51.39 
 
 		 220 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4724  transposase  51.39 
 
 		 220 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2997  transposase  51.39 
 
 		 220 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.894838  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4008  transposase  51.39 
 
 		 220 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4505  transposase  51.39 
 
 		 220 aa  148  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  46.72 
 
 		 390 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1560  transposase  46.72 
 
 		 206 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1324  hypothetical protein  45.99 
 
 		 205 aa  136  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527658  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1466  transposase  45.83 
 
 		 207 aa  136  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  46.67 
 
 		 375 aa  133  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0540  transposase  44.44 
 
 		 187 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2626  transposase  44.44 
 
 		 186 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1251  transposase  44.44 
 
 		 205 aa  126  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0967  transposase  39.58 
 
 		 207 aa  124  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.805263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0631  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0073  transposase  45.45 
 
 		 186 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.748359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2163  transposase  45.45 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0065  transposase  48.86 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2698  transposase  45.65 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2350  transposase  50 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00203316  normal  0.0195655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0804  hypothetical protein  39.34 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  26.28 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  28.57 
 
 		 351 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1050  transposase  38.33 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  25.19 
 
 		 351 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  28.97 
 
 		 362 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  28.97 
 
 		 362 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  28.97 
 
 		 362 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  28.97 
 
 		 362 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  28.97 
 
 		 362 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  28.97 
 
 		 362 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2484  putative transposase  28 
 
 		 194 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.350833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  28.8 
 
 		 353 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  22.83 
 
 		 387 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  22.83 
 
 		 387 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  22.83 
 
 		 387 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  23.88 
 
 		 391 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  25.2 
 
 		 363 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  27.2 
 
 		 351 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  25.2 
 
 		 363 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  25.2 
 
 		 363 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2934  putative transposase  34.67 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  26.52 
 
 		 363 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  26.52 
 
 		 363 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  26.52 
 
 		 363 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  26.52 
 
 		 363 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  24.03 
 
 		 354 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  27.07 
 
 		 377 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  30.11 
 
 		 363 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  30.11 
 
 		 363 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2150  IS630 family transposase  20 
 
 		 195 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.263283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  30.11 
 
 		 363 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  23.26 
 
 		 356 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  25.19 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  25.19 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  25.19 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  25.19 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  25.19 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  22.48 
 
 		 356 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  25.19 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  25.19 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  25.19 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  25.19 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  25.19 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  25.19 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  25.89 
 
 		 356 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  26.21 
 
 		 583 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  19.86 
 
 		 365 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0787  hypothetical protein  33.85 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  24.22 
 
 		 364 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  28.41 
 
 		 356 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1944  hypothetical protein  24.06 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.181945  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0953  ISRSO5-transposase protein  30.49 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0694776  normal  0.301746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1872  IS630 family transposase  19.86 
 
 		 376 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.226445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  20.61 
 
 		 343 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  20.61 
 
 		 353 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  20.61 
 
 		 353 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  20.83 
 
 		 366 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  20.28 
 
 		 363 aa  40  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  21.99 
 
 		 364 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>