More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2887 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  100 
 
 		 391 aa  795    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  58.79 
 
 		 387 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  58.79 
 
 		 387 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  58.79 
 
 		 387 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1872  IS630 family transposase  50 
 
 		 376 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.226445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  50 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  36.87 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2150  IS630 family transposase  57.41 
 
 		 195 aa  193  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.263283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  36.93 
 
 		 356 aa  186  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  36.93 
 
 		 356 aa  186  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  36.93 
 
 		 356 aa  186  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  36.1 
 
 		 363 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  35.39 
 
 		 363 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  36.1 
 
 		 363 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  36.1 
 
 		 363 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  35.39 
 
 		 363 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  36.1 
 
 		 363 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  36.1 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  35.57 
 
 		 370 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  35.28 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  32.78 
 
 		 363 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  32.78 
 
 		 363 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  32.78 
 
 		 363 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  33.15 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  33.33 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  32.19 
 
 		 363 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  32.19 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  32.19 
 
 		 363 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  32.19 
 
 		 363 aa  157  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  32.19 
 
 		 363 aa  157  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  32.19 
 
 		 363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  34.67 
 
 		 365 aa  156  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  31.46 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  30.27 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  31.55 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1882  transposase  45.89 
 
 		 178 aa  153  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  33.24 
 
 		 346 aa  152  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  30.22 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  30.73 
 
 		 363 aa  149  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  33.53 
 
 		 356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  31.58 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  33.24 
 
 		 356 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  30.52 
 
 		 364 aa  146  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  31.18 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  33.95 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  31.56 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  31.56 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  31.78 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  31.78 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  31.78 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  31.78 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  31.78 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  31.78 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  31.78 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  29.04 
 
 		 357 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  29.04 
 
 		 357 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  29.04 
 
 		 357 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  29.04 
 
 		 357 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  29.04 
 
 		 357 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  30.56 
 
 		 370 aa  143  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  31.88 
 
 		 363 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  30.77 
 
 		 362 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  30.77 
 
 		 362 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  30.77 
 
 		 362 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  30.77 
 
 		 362 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  30.77 
 
 		 362 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  30.77 
 
 		 362 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  31.59 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  31.89 
 
 		 361 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  31.89 
 
 		 361 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  31.04 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  31.04 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  31.04 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  30.91 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  31.04 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  30.31 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  31.51 
 
 		 363 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  30.22 
 
 		 364 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  30.38 
 
 		 362 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  30.38 
 
 		 362 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  29.26 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  35.82 
 
 		 583 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  30.73 
 
 		 356 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  29.97 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  29.97 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  29.97 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  29.57 
 
 		 362 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4771  putative transposase  37.25 
 
 		 282 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  32.03 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  31.07 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  26.82 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  26.82 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  28.25 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  28.25 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  31.64 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  25.96 
 
 		 377 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  31.96 
 
 		 362 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  28.25 
 
 		 353 aa  133  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4459  transposase, putative  31.28 
 
 		 365 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  30.5 
 
 		 379 aa  133  6.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>