277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2084 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  100 
 
 		 387 aa  780    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  100 
 
 		 387 aa  780    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  100 
 
 		 387 aa  780    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  58.79 
 
 		 391 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1872  IS630 family transposase  53.52 
 
 		 376 aa  332  5e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.226445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  53.52 
 
 		 365 aa  332  6e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2150  IS630 family transposase  81.4 
 
 		 195 aa  279  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.263283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  35.07 
 
 		 376 aa  179  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  37.16 
 
 		 356 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  37.16 
 
 		 356 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  37.16 
 
 		 356 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  34.62 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  35.04 
 
 		 374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  34.38 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  32.97 
 
 		 363 aa  162  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  32.8 
 
 		 363 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  32.8 
 
 		 363 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  32.8 
 
 		 363 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  32.88 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  32.71 
 
 		 363 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  32.71 
 
 		 363 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  35.86 
 
 		 370 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  31.81 
 
 		 360 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  33.33 
 
 		 366 aa  157  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  32.6 
 
 		 363 aa  157  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  32.79 
 
 		 363 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  32.43 
 
 		 363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  33.87 
 
 		 363 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  33.87 
 
 		 363 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  33.87 
 
 		 363 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  33.87 
 
 		 363 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  33.87 
 
 		 363 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  33.87 
 
 		 363 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  33.87 
 
 		 363 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  32.43 
 
 		 363 aa  156  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  32.14 
 
 		 346 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  32.43 
 
 		 363 aa  155  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  32.43 
 
 		 363 aa  155  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  32.43 
 
 		 363 aa  155  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  32.97 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  32.97 
 
 		 626 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  33.06 
 
 		 362 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  33.06 
 
 		 362 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  33.06 
 
 		 362 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  33.06 
 
 		 362 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  33.06 
 
 		 362 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  33.06 
 
 		 362 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  33.6 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1882  transposase  44.93 
 
 		 178 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  29.83 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  31.61 
 
 		 357 aa  149  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  31.61 
 
 		 357 aa  149  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  31.61 
 
 		 357 aa  149  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  31.61 
 
 		 357 aa  149  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  31.61 
 
 		 357 aa  149  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0064  hypothetical protein  90.7 
 
 		 160 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  33.06 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  33.06 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  33.06 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  33.06 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  33.06 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  33.06 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  33.06 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  33.06 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  33.06 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  33.06 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  33.06 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  33.06 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  33.06 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  33.06 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  33.06 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  33.63 
 
 		 361 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  33.63 
 
 		 361 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  32.58 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  33.43 
 
 		 363 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  33.43 
 
 		 363 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  33.43 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  32.53 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  31.34 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  31.49 
 
 		 389 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  31.49 
 
 		 362 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  33.15 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  33.15 
 
 		 363 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  33.15 
 
 		 363 aa  143  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  32.11 
 
 		 356 aa  143  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  31.22 
 
 		 362 aa  143  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  31.22 
 
 		 362 aa  143  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  32.3 
 
 		 356 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  33.15 
 
 		 363 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  32.11 
 
 		 356 aa  142  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  31.94 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  30.77 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  31.11 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  31.19 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  33.06 
 
 		 366 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  30.6 
 
 		 364 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  28.03 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  30.49 
 
 		 367 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  29.65 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  28.03 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>