280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3423 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  100 
 
 		 364 aa  753    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  52.34 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  52.07 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  52.34 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  52.07 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  51.79 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  52.07 
 
 		 363 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  52.07 
 
 		 363 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  46.4 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  46.4 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  46.4 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  46.4 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  46.4 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  53.04 
 
 		 583 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  47.28 
 
 		 361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  47.28 
 
 		 361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  48.84 
 
 		 356 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  45.27 
 
 		 370 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  46.63 
 
 		 374 aa  296  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  46.88 
 
 		 362 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  45.98 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  45.95 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  45.95 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  43.29 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  45.95 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  45.71 
 
 		 626 aa  286  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  43.01 
 
 		 367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  44.19 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  43.22 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  43.75 
 
 		 365 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  44.54 
 
 		 362 aa  278  9e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  44.54 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  44.54 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  44.54 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  43.1 
 
 		 362 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  42.61 
 
 		 355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  44.13 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  42.86 
 
 		 366 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  44.31 
 
 		 362 aa  272  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  44.09 
 
 		 365 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  44.31 
 
 		 362 aa  272  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  44.31 
 
 		 362 aa  272  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  44.31 
 
 		 362 aa  272  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  42.17 
 
 		 363 aa  272  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  42.17 
 
 		 363 aa  272  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  42.17 
 
 		 363 aa  272  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  41.09 
 
 		 363 aa  272  7e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  42.29 
 
 		 363 aa  272  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  41.76 
 
 		 366 aa  272  8.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  41.09 
 
 		 363 aa  271  9e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  43.27 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  40.8 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  43.27 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  41.09 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  41.16 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  40.8 
 
 		 363 aa  271  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  42.17 
 
 		 363 aa  268  7e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  42.32 
 
 		 375 aa  269  7e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  38.89 
 
 		 361 aa  268  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  38.89 
 
 		 361 aa  268  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  38.89 
 
 		 361 aa  268  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  43.14 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  43.14 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  43.14 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  43.14 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  43.14 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  43.14 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  43.14 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  43.68 
 
 		 359 aa  266  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  41.88 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  41.88 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  41.88 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  41.88 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  41.88 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  41.88 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  42.86 
 
 		 363 aa  262  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  44.61 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  42.27 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  42.27 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  42.27 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  42.27 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  42.27 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  42.27 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  42.27 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  42.27 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>