More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4599 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  97.19 
 
 		 356 aa  711    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  96.91 
 
 		 356 aa  709    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  100 
 
 		 354 aa  732    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  45.14 
 
 		 370 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  41.52 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  42.51 
 
 		 360 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  44.31 
 
 		 366 aa  252  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  41.64 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  41.64 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  41.64 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  41.64 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  45.18 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  41.64 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  43.71 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  43.71 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  43.71 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  43.71 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  43.71 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  43.71 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  43.71 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  43.71 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  43.71 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  42.99 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  44.09 
 
 		 373 aa  238  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  40.18 
 
 		 363 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  38.35 
 
 		 363 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  38.05 
 
 		 363 aa  236  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  38.05 
 
 		 363 aa  236  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  40.06 
 
 		 355 aa  235  7e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  38.05 
 
 		 363 aa  235  9e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  38.05 
 
 		 363 aa  235  9e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  38.05 
 
 		 363 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  40.41 
 
 		 362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  40.88 
 
 		 356 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  40.12 
 
 		 362 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  40.12 
 
 		 362 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  40.12 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  39.23 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  39.23 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  39.53 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  40.9 
 
 		 374 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  41.28 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  41.28 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  41.28 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  41.28 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  41.28 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  41.28 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  41.28 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  41.28 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  41.28 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  41.28 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  41.28 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  41.28 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  41.28 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  41.28 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  41.28 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  40.59 
 
 		 362 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  40.59 
 
 		 362 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  40.59 
 
 		 362 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  40.59 
 
 		 362 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  40.59 
 
 		 362 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  40.59 
 
 		 362 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  41.44 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  41.44 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  39.38 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  40.75 
 
 		 379 aa  226  6e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  38.64 
 
 		 362 aa  226  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  39.7 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  39.7 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  39.7 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  39.47 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  41.88 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  39.47 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  39.47 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  37.57 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  39.47 
 
 		 363 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  39.47 
 
 		 363 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  39.47 
 
 		 363 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  37.9 
 
 		 361 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  37.9 
 
 		 361 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  37.9 
 
 		 361 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  37.43 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  39.17 
 
 		 363 aa  222  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  37.98 
 
 		 353 aa  222  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  37.98 
 
 		 353 aa  222  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  37.98 
 
 		 353 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  37.98 
 
 		 353 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  37.69 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  37.69 
 
 		 343 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  38.69 
 
 		 367 aa  219  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  39.64 
 
 		 363 aa  219  7e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  37.39 
 
 		 353 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  37.5 
 
 		 362 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  37.5 
 
 		 362 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  37.5 
 
 		 362 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  37.5 
 
 		 362 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  38.39 
 
 		 367 aa  216  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  38.08 
 
 		 356 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  38.66 
 
 		 364 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  36.84 
 
 		 366 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>