264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5740 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  100 
 
 
356 aa  745    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  73.91 
 
 
353 aa  535  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  73.62 
 
 
353 aa  533  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  73.62 
 
 
353 aa  532  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  73.33 
 
 
353 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  73.04 
 
 
353 aa  529  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  73.33 
 
 
353 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  72.65 
 
 
343 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  62.14 
 
 
351 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  63.87 
 
 
351 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  61.27 
 
 
351 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  68.55 
 
 
353 aa  361  9e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2523  putative transposase  60.7 
 
 
285 aa  352  7e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2484  putative transposase  67.72 
 
 
194 aa  279  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.350833  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  42.55 
 
 
360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  41.18 
 
 
361 aa  270  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  41.18 
 
 
361 aa  270  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  40.66 
 
 
362 aa  265  8e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  40.66 
 
 
362 aa  265  8e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  40.72 
 
 
374 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  40.36 
 
 
356 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  41.14 
 
 
346 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  41.18 
 
 
363 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  41.18 
 
 
363 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  41.18 
 
 
363 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  41.32 
 
 
363 aa  260  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  38.86 
 
 
357 aa  258  8e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  38.86 
 
 
357 aa  258  8e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  38.86 
 
 
357 aa  258  8e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  38.86 
 
 
357 aa  258  8e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  38.86 
 
 
357 aa  258  8e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  40.54 
 
 
363 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  40.42 
 
 
366 aa  256  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3844  putative transposase  75.32 
 
 
163 aa  256  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.585584  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  40.54 
 
 
626 aa  256  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  41.69 
 
 
379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  38.81 
 
 
355 aa  253  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  40 
 
 
362 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  40.06 
 
 
367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  40.24 
 
 
362 aa  251  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  40.24 
 
 
362 aa  251  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  40.24 
 
 
362 aa  251  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  40.24 
 
 
362 aa  251  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  38.86 
 
 
365 aa  251  9.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  37.35 
 
 
361 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  37.35 
 
 
361 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  37.35 
 
 
361 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  38.75 
 
 
366 aa  250  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  39.76 
 
 
367 aa  250  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  41.3 
 
 
375 aa  249  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  42.22 
 
 
363 aa  249  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  42.22 
 
 
363 aa  249  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  42.22 
 
 
363 aa  249  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  42.22 
 
 
363 aa  249  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  42.22 
 
 
363 aa  249  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  42.22 
 
 
363 aa  249  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  42.22 
 
 
363 aa  249  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  39.76 
 
 
370 aa  249  7e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  42.22 
 
 
363 aa  249  8e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  39.04 
 
 
359 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  41.32 
 
 
362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  37.76 
 
 
362 aa  246  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  39.1 
 
 
363 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  39.1 
 
 
363 aa  245  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  39.1 
 
 
363 aa  245  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  40.06 
 
 
340 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  38.64 
 
 
364 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  38.64 
 
 
364 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  38.64 
 
 
364 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  38.64 
 
 
364 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  38.64 
 
 
364 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  38.64 
 
 
364 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  38.64 
 
 
364 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  38.64 
 
 
364 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  38.64 
 
 
364 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  37.46 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  37.11 
 
 
364 aa  243  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  40 
 
 
370 aa  243  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  37.16 
 
 
362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  37.16 
 
 
362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  38.28 
 
 
366 aa  243  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  37.95 
 
 
363 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  37.95 
 
 
363 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  37.95 
 
 
363 aa  241  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  37.95 
 
 
363 aa  241  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  37.95 
 
 
363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  41.21 
 
 
370 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  41.21 
 
 
370 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  37.95 
 
 
363 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  37.65 
 
 
363 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 
359 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 
359 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 
359 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 
359 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 
359 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 
359 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 
359 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 
359 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 
359 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 
359 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>