295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3196 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  100 
 
 
351 aa  727    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  84.33 
 
 
351 aa  616  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  83.48 
 
 
351 aa  613  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2523  putative transposase  83.86 
 
 
285 aa  497  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  79.64 
 
 
353 aa  461  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  64.33 
 
 
353 aa  451  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  64.62 
 
 
353 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  64.04 
 
 
353 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  64.04 
 
 
353 aa  447  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  64.04 
 
 
353 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  64.04 
 
 
353 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  63.87 
 
 
356 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  63.8 
 
 
343 aa  441  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4503  hypothetical protein  83.74 
 
 
253 aa  355  5.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2484  putative transposase  84.02 
 
 
194 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.350833  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  42.07 
 
 
361 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  42.07 
 
 
361 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  42.07 
 
 
361 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  41.44 
 
 
362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  41.44 
 
 
389 aa  266  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  41.14 
 
 
362 aa  266  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  41.14 
 
 
362 aa  266  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  41.62 
 
 
365 aa  266  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  42.94 
 
 
367 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  42.94 
 
 
367 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  42.51 
 
 
361 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  42.51 
 
 
361 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  43.58 
 
 
355 aa  262  6e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  42.94 
 
 
370 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  42.94 
 
 
346 aa  262  8e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  40.84 
 
 
374 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  40.06 
 
 
357 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  40.06 
 
 
357 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  40.06 
 
 
357 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  40.06 
 
 
357 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  40.06 
 
 
357 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  42.94 
 
 
360 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  41.49 
 
 
362 aa  259  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  41.49 
 
 
362 aa  259  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  41.49 
 
 
362 aa  259  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  41.49 
 
 
362 aa  259  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  41.19 
 
 
363 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  41.19 
 
 
366 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  41.19 
 
 
626 aa  256  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  40.9 
 
 
362 aa  255  8e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  40.9 
 
 
362 aa  255  8e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  41.14 
 
 
362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  40.95 
 
 
366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  40.53 
 
 
364 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  40.42 
 
 
362 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  40.42 
 
 
362 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  40.42 
 
 
362 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  40.42 
 
 
362 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  40.42 
 
 
362 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  40.42 
 
 
362 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  41.27 
 
 
340 aa  252  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  41.79 
 
 
363 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  41.79 
 
 
363 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  40.72 
 
 
356 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  41.79 
 
 
363 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3748  putative transposase  81.63 
 
 
151 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  40.84 
 
 
362 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  39.01 
 
 
370 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  43.22 
 
 
370 aa  246  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  43.22 
 
 
370 aa  246  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  41.32 
 
 
363 aa  245  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  40.84 
 
 
363 aa  245  9e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  41.32 
 
 
363 aa  245  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  41.32 
 
 
363 aa  245  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3844  putative transposase  71.97 
 
 
163 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.585584  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  39.16 
 
 
363 aa  242  7.999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  39.52 
 
 
364 aa  242  7.999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  39.16 
 
 
363 aa  241  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  38.86 
 
 
363 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  38.86 
 
 
366 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  39.22 
 
 
364 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  38.86 
 
 
363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  38.86 
 
 
363 aa  239  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  38.55 
 
 
363 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  40.87 
 
 
375 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  40.12 
 
 
364 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  40.12 
 
 
364 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  40.12 
 
 
364 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  40.12 
 
 
364 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  40.12 
 
 
364 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>