278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1402 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  100 
 
 
351 aa  724    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  96.58 
 
 
351 aa  698    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  83.48 
 
 
351 aa  591  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2523  putative transposase  98.6 
 
 
285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  87.86 
 
 
353 aa  503  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  62.57 
 
 
353 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  61.99 
 
 
353 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  61.99 
 
 
353 aa  437  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  62.28 
 
 
353 aa  441  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  61.27 
 
 
356 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  61.99 
 
 
353 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  61.99 
 
 
353 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  61.83 
 
 
343 aa  430  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4503  hypothetical protein  99.01 
 
 
253 aa  413  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2484  putative transposase  93.3 
 
 
194 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.350833  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3748  putative transposase  100 
 
 
151 aa  299  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  43.88 
 
 
361 aa  269  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  43.88 
 
 
361 aa  269  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  43.88 
 
 
361 aa  269  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  41.27 
 
 
367 aa  263  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  41.27 
 
 
367 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  41.57 
 
 
370 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  42.12 
 
 
365 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  41.27 
 
 
362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  41.27 
 
 
362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  41.27 
 
 
362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  41.27 
 
 
362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  40.54 
 
 
374 aa  255  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  43.41 
 
 
361 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  43.41 
 
 
361 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  41.16 
 
 
340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  40.54 
 
 
362 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  40.54 
 
 
389 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  40.24 
 
 
362 aa  252  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  40.24 
 
 
362 aa  252  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  42.68 
 
 
370 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  42.68 
 
 
370 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  41.67 
 
 
366 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  43.31 
 
 
366 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  41.14 
 
 
362 aa  248  9e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  43.51 
 
 
346 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  41.27 
 
 
360 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  43.71 
 
 
355 aa  244  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  42.12 
 
 
363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  37.91 
 
 
370 aa  242  9e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  40.48 
 
 
356 aa  242  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  42.22 
 
 
363 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  42.12 
 
 
626 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  42.22 
 
 
363 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  42.22 
 
 
363 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  39.54 
 
 
362 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  39.54 
 
 
362 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  38.94 
 
 
364 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  39.94 
 
 
357 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  39.94 
 
 
357 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  39.94 
 
 
357 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  39.94 
 
 
357 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  39.94 
 
 
357 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  40.69 
 
 
366 aa  238  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  40.18 
 
 
363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  38.55 
 
 
363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  38.55 
 
 
363 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  39.7 
 
 
363 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  39.7 
 
 
363 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  39.7 
 
 
363 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  39.48 
 
 
362 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  38.25 
 
 
363 aa  233  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  38.25 
 
 
363 aa  232  6e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  40 
 
 
364 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  38.02 
 
 
362 aa  232  8.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  38.02 
 
 
362 aa  232  8.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  38.02 
 
 
362 aa  232  8.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  38.02 
 
 
362 aa  232  8.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  38.02 
 
 
362 aa  232  8.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  38.02 
 
 
362 aa  232  8.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  38.25 
 
 
363 aa  232  9e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4634  hypothetical protein  99.14 
 
 
152 aa  232  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  37.95 
 
 
363 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  40.87 
 
 
375 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  39.94 
 
 
364 aa  229  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  39.32 
 
 
379 aa  228  8e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  40.72 
 
 
359 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  40.72 
 
 
359 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  40.72 
 
 
359 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  40.72 
 
 
359 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  40.72 
 
 
359 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  40.72 
 
 
359 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  40.72 
 
 
359 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  40.72 
 
 
359 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  40.72 
 
 
359 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  40.72 
 
 
359 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  40.72 
 
 
359 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  40.72 
 
 
359 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  40.72 
 
 
359 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  40.72 
 
 
359 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  40.72 
 
 
359 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3844  putative transposase  67.52 
 
 
163 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.585584  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  37.72 
 
 
363 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  40.63 
 
 
363 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  40.63 
 
 
363 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>