More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4886 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  99.43 
 
 
353 aa  734    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  100 
 
 
353 aa  736    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  98.87 
 
 
353 aa  728    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  98.25 
 
 
343 aa  707    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  99.43 
 
 
353 aa  732    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  98.58 
 
 
353 aa  726    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  98.87 
 
 
353 aa  728    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  73.62 
 
 
356 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  63.16 
 
 
351 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  64.04 
 
 
351 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  61.99 
 
 
351 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2523  putative transposase  61.4 
 
 
285 aa  357  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  69.67 
 
 
353 aa  355  5.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3844  putative transposase  96.32 
 
 
163 aa  333  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.585584  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2484  putative transposase  70.81 
 
 
194 aa  282  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.350833  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  41.27 
 
 
360 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  40.46 
 
 
364 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  40.46 
 
 
364 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  40.46 
 
 
364 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  40.46 
 
 
364 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  40.46 
 
 
364 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  40.46 
 
 
364 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  40.46 
 
 
364 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  40.46 
 
 
364 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  40.46 
 
 
364 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  39.6 
 
 
364 aa  257  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  41.32 
 
 
355 aa  258  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  38.82 
 
 
361 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  38.82 
 
 
361 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  38.82 
 
 
361 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  40.42 
 
 
346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  40.35 
 
 
363 aa  252  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  39.64 
 
 
361 aa  252  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  39.64 
 
 
361 aa  252  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  40.35 
 
 
626 aa  252  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  39.7 
 
 
363 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  39.7 
 
 
363 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  39.7 
 
 
363 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  39.7 
 
 
363 aa  250  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  40.56 
 
 
375 aa  249  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  38.25 
 
 
374 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  38.66 
 
 
359 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  38.51 
 
 
356 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  38.67 
 
 
357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  38.67 
 
 
357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  38.67 
 
 
357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  38.67 
 
 
357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  38.67 
 
 
357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  39.46 
 
 
362 aa  242  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4503  hypothetical protein  59.11 
 
 
253 aa  242  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  37.98 
 
 
366 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
359 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  38.02 
 
 
362 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  38.02 
 
 
362 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  40.3 
 
 
363 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  40.3 
 
 
363 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  40.3 
 
 
363 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  40.3 
 
 
363 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  40.3 
 
 
363 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  40.3 
 
 
363 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  40.3 
 
 
363 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  40.3 
 
 
363 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  36.97 
 
 
365 aa  239  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  39.71 
 
 
363 aa  238  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  39.71 
 
 
363 aa  238  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  38.97 
 
 
362 aa  238  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  39.71 
 
 
363 aa  238  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  38.97 
 
 
362 aa  238  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  38.97 
 
 
362 aa  238  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  38.97 
 
 
362 aa  238  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  40 
 
 
362 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  37.01 
 
 
366 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  40.66 
 
 
379 aa  237  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  38.67 
 
 
363 aa  236  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  38.07 
 
 
363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  38.07 
 
 
363 aa  235  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  38.07 
 
 
363 aa  235  9e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  38.07 
 
 
363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  40.44 
 
 
367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  38.07 
 
 
363 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  36.8 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  40.44 
 
 
367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  37.54 
 
 
362 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  37.31 
 
 
363 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  40.75 
 
 
370 aa  233  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  37.24 
 
 
389 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>