More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3844 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3844  putative transposase  100 
 
 
163 aa  343  6e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.585584  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  97.55 
 
 
353 aa  337  5e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  96.93 
 
 
353 aa  334  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  96.93 
 
 
353 aa  335  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  97.55 
 
 
353 aa  335  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 
353 aa  334  2.9999999999999997e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 
353 aa  333  7e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  96.08 
 
 
343 aa  318  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  75.32 
 
 
356 aa  256  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  71.97 
 
 
351 aa  242  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  69.43 
 
 
351 aa  233  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2484  putative transposase  69.43 
 
 
194 aa  232  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.350833  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  68.79 
 
 
353 aa  227  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  67.52 
 
 
351 aa  226  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  48.65 
 
 
355 aa  150  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2523  putative transposase  70 
 
 
285 aa  147  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  47.62 
 
 
359 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  47.62 
 
 
359 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  47.62 
 
 
359 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  47.62 
 
 
359 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  47.62 
 
 
359 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  47.62 
 
 
359 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  47.62 
 
 
359 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  47.62 
 
 
359 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  47.62 
 
 
359 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  47.62 
 
 
359 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  47.62 
 
 
359 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  47.62 
 
 
359 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  47.62 
 
 
359 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  47.62 
 
 
359 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  47.62 
 
 
359 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  42.68 
 
 
364 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  42.68 
 
 
364 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  42.68 
 
 
364 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  42.68 
 
 
364 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  42.68 
 
 
364 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  42.68 
 
 
364 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  42.68 
 
 
364 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  42.68 
 
 
364 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  42.68 
 
 
364 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  43.62 
 
 
346 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  43.24 
 
 
367 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  43.24 
 
 
367 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  42.04 
 
 
364 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  41.89 
 
 
362 aa  133  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  41.89 
 
 
362 aa  133  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  41.89 
 
 
362 aa  133  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  41.89 
 
 
362 aa  133  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  42.18 
 
 
365 aa  133  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  41.89 
 
 
360 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  43.92 
 
 
363 aa  133  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  42.28 
 
 
366 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  43.24 
 
 
370 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  43.92 
 
 
626 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  40.54 
 
 
374 aa  131  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  43.54 
 
 
379 aa  131  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  44.59 
 
 
362 aa  130  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  41.22 
 
 
361 aa  130  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  41.22 
 
 
361 aa  130  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  40.54 
 
 
356 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  41.22 
 
 
365 aa  127  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  41.22 
 
 
375 aa  127  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  41.32 
 
 
370 aa  127  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  41.38 
 
 
340 aa  127  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  39.49 
 
 
359 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  40.94 
 
 
363 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  40.94 
 
 
363 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  40.94 
 
 
363 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  39.86 
 
 
363 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  38.78 
 
 
361 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  38.78 
 
 
361 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  38.78 
 
 
361 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0450  remnant of ISRSO5-transposase protein  42.57 
 
 
179 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.681921  normal  0.284705 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  41.22 
 
 
363 aa  124  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  39.86 
 
 
362 aa  124  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  42.57 
 
 
363 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  42.57 
 
 
363 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  42.57 
 
 
363 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  42.57 
 
 
363 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  42.57 
 
 
363 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  42.57 
 
 
363 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  42.57 
 
 
363 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  42.57 
 
 
363 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  41.89 
 
 
364 aa  124  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  40.14 
 
 
357 aa  124  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  40.14 
 
 
357 aa  124  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  40.14 
 
 
357 aa  124  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  40.14 
 
 
357 aa  124  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  40.14 
 
 
357 aa  124  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  39.73 
 
 
363 aa  124  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  39.73 
 
 
363 aa  124  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  39.19 
 
 
362 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  42.66 
 
 
373 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  39.19 
 
 
389 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  39.19 
 
 
362 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  39.73 
 
 
363 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  39.04 
 
 
363 aa  121  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  37.84 
 
 
363 aa  121  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  37.84 
 
 
363 aa  121  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  37.84 
 
 
363 aa  121  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>