More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3895 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  92.86 
 
 
364 aa  699    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  92.86 
 
 
364 aa  699    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  92.86 
 
 
364 aa  699    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  92.86 
 
 
364 aa  699    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  92.86 
 
 
364 aa  699    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  92.86 
 
 
364 aa  699    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  92.86 
 
 
364 aa  699    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  92.86 
 
 
364 aa  699    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  92.86 
 
 
364 aa  699    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  100 
 
 
364 aa  748    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  71.67 
 
 
366 aa  557  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  73.26 
 
 
359 aa  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3014  hypothetical protein  90.95 
 
 
311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  60.63 
 
 
373 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5437  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  69.2 
 
 
300 aa  425  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218978  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0513  transposase  67.82 
 
 
287 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  51.4 
 
 
361 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  51.4 
 
 
361 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  51.4 
 
 
361 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  50.85 
 
 
379 aa  348  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8357  putative transposase  51.43 
 
 
356 aa  343  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  50 
 
 
346 aa  339  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  48.7 
 
 
360 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  49.13 
 
 
361 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  49.13 
 
 
361 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  47.7 
 
 
355 aa  333  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  48.73 
 
 
362 aa  332  8e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  48.73 
 
 
362 aa  332  8e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  48.73 
 
 
389 aa  332  9e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  49.27 
 
 
362 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  46.51 
 
 
365 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  48.71 
 
 
374 aa  329  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  46.74 
 
 
362 aa  327  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  47.01 
 
 
356 aa  325  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  48.66 
 
 
375 aa  324  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  46.61 
 
 
363 aa  323  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  46.84 
 
 
366 aa  322  9.000000000000001e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  47.29 
 
 
362 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  47.29 
 
 
362 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  47.71 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  47.71 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  47.71 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  47.71 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  47.71 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  47.71 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  47.71 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  47.71 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  47.71 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  47.71 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  47.71 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  47.71 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  47.71 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  47.71 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  47.71 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  45.74 
 
 
362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  45.74 
 
 
362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  45.74 
 
 
362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  45.74 
 
 
362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  46.29 
 
 
363 aa  319  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  46.29 
 
 
363 aa  319  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  46.29 
 
 
363 aa  319  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  47.55 
 
 
370 aa  316  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  45.51 
 
 
362 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  45.71 
 
 
363 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  45.71 
 
 
363 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  45.71 
 
 
363 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  45.71 
 
 
363 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  45.71 
 
 
363 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  45.71 
 
 
363 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  45.71 
 
 
363 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  44.06 
 
 
363 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  44.86 
 
 
363 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  44.06 
 
 
363 aa  310  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  44.44 
 
 
363 aa  310  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  47.04 
 
 
367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  44.06 
 
 
363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  44.06 
 
 
363 aa  310  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  44.9 
 
 
362 aa  309  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  44.9 
 
 
362 aa  309  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  44.9 
 
 
362 aa  309  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  44.9 
 
 
362 aa  309  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  44.9 
 
 
362 aa  309  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  44.9 
 
 
362 aa  309  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  43.77 
 
 
363 aa  309  5.9999999999999995e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  45.43 
 
 
363 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  46.73 
 
 
367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  45.93 
 
 
363 aa  305  6e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  46.95 
 
 
340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  45.93 
 
 
626 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  46.37 
 
 
370 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  44.41 
 
 
363 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  44.41 
 
 
363 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  45.56 
 
 
364 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  44.41 
 
 
363 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  43.63 
 
 
357 aa  295  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  43.63 
 
 
357 aa  295  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  43.63 
 
 
357 aa  295  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  43.63 
 
 
357 aa  295  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  43.63 
 
 
357 aa  295  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4694  hypothetical protein  60.73 
 
 
337 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>