153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3748 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3748  putative transposase  100 
 
 
151 aa  306  5.9999999999999995e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  100 
 
 
351 aa  300  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  100 
 
 
351 aa  299  8.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2523  putative transposase  99.32 
 
 
285 aa  299  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4503  hypothetical protein  98.64 
 
 
253 aa  295  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4634  hypothetical protein  99.14 
 
 
152 aa  230  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  81.63 
 
 
351 aa  229  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4216  hypothetical protein  96.84 
 
 
163 aa  183  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0960652  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2483  putative transposase  98.72 
 
 
82 aa  152  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.244934  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  48.98 
 
 
353 aa  144  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  48.98 
 
 
353 aa  144  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  48.98 
 
 
353 aa  144  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  48.98 
 
 
353 aa  143  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  51.02 
 
 
356 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  48.3 
 
 
353 aa  140  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  48.3 
 
 
353 aa  140  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  48.3 
 
 
343 aa  139  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1068  hypothetical protein  67.03 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650307  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  69.74 
 
 
353 aa  104  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  43.54 
 
 
361 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  43.54 
 
 
361 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  43.54 
 
 
361 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  38.89 
 
 
363 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  39.73 
 
 
362 aa  92  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  39.73 
 
 
389 aa  92  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  39.04 
 
 
362 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  39.04 
 
 
362 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  37.93 
 
 
362 aa  88.2  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  37.93 
 
 
362 aa  88.2  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  37.93 
 
 
362 aa  88.2  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  37.93 
 
 
340 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  37.93 
 
 
362 aa  88.2  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  38.67 
 
 
362 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  38.67 
 
 
362 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  35.1 
 
 
364 aa  87.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  40.62 
 
 
366 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  40.32 
 
 
365 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  38.24 
 
 
375 aa  85.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  38.36 
 
 
363 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  38.36 
 
 
363 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  38.36 
 
 
363 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  34.44 
 
 
370 aa  85.5  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  38.51 
 
 
362 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  35.62 
 
 
374 aa  84  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  37.32 
 
 
364 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  38.71 
 
 
366 aa  80.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  36.55 
 
 
360 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  41.13 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  41.13 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  34.48 
 
 
370 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  34.48 
 
 
370 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  34.48 
 
 
367 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  34.48 
 
 
367 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  34.48 
 
 
370 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  37.9 
 
 
362 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  37.9 
 
 
362 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  37.9 
 
 
362 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  37.9 
 
 
362 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  37.9 
 
 
362 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  37.9 
 
 
362 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  39.06 
 
 
363 aa  77  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  35.62 
 
 
356 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  39.06 
 
 
626 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  33.79 
 
 
362 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  32.89 
 
 
363 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  35.17 
 
 
363 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  32.89 
 
 
363 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  32.89 
 
 
363 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  32.89 
 
 
363 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  32.89 
 
 
363 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  32.89 
 
 
363 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  32.89 
 
 
363 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  35.17 
 
 
363 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4771  putative transposase  32.89 
 
 
282 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451842  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  34.48 
 
 
363 aa  70.5  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  34.48 
 
 
363 aa  70.1  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  34.48 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  33.79 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  34.65 
 
 
357 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  34.65 
 
 
357 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  35.77 
 
 
366 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  34.65 
 
 
357 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  34.65 
 
 
357 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  34.65 
 
 
357 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  37.19 
 
 
359 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4459  transposase, putative  36.05 
 
 
365 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0453  remnant of ISRSO5 transposase protein  36.36 
 
 
194 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.405912 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0513  transposase  37.7 
 
 
287 aa  67  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  36.36 
 
 
363 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  36.36 
 
 
363 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  36.36 
 
 
363 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  36.36 
 
 
363 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  36.36 
 
 
363 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  36.36 
 
 
363 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  36.36 
 
 
363 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  36.36 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  35.1 
 
 
359 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  35.1 
 
 
359 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  35.1 
 
 
359 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  35.1 
 
 
359 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>