120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4216 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4216  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  332  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0960652  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4634  hypothetical protein  79.75 
 
 
152 aa  245  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2523  putative transposase  97.89 
 
 
285 aa  187  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  96.84 
 
 
351 aa  185  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  96.84 
 
 
351 aa  185  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4503  hypothetical protein  94.95 
 
 
253 aa  184  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3748  putative transposase  96.84 
 
 
151 aa  183  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2483  putative transposase  94.87 
 
 
82 aa  150  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.244934  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  88.57 
 
 
353 aa  133  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2484  putative transposase  87.14 
 
 
194 aa  128  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.350833  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  75.79 
 
 
351 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1068  hypothetical protein  65.93 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650307  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  65.57 
 
 
353 aa  90.9  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  63.93 
 
 
353 aa  89.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  63.93 
 
 
353 aa  89.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  63.93 
 
 
353 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  63.93 
 
 
353 aa  89.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  63.93 
 
 
353 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  61.54 
 
 
356 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3844  putative transposase  62.3 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.585584  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  64.91 
 
 
343 aa  85.1  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  42.31 
 
 
370 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  52.27 
 
 
355 aa  50.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00650  isrso5-transposase protein  42.31 
 
 
113 aa  50.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0193031  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  42.31 
 
 
357 aa  50.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  42.31 
 
 
357 aa  50.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  42.31 
 
 
357 aa  50.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  42.31 
 
 
357 aa  50.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  42.31 
 
 
357 aa  50.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  40.38 
 
 
367 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  40.38 
 
 
367 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0932  hypothetical protein  35.37 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  43.4 
 
 
346 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  38.46 
 
 
362 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  38.46 
 
 
362 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  38.46 
 
 
362 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  38.46 
 
 
362 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0450  remnant of ISRSO5-transposase protein  38.24 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.681921  normal  0.284705 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  32.41 
 
 
389 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  33.68 
 
 
364 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  35.48 
 
 
362 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  37.7 
 
 
366 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  32.26 
 
 
374 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  37.7 
 
 
364 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  37.7 
 
 
364 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  37.7 
 
 
364 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  37.7 
 
 
364 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  37.7 
 
 
364 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  37.7 
 
 
364 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  37.7 
 
 
364 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  37.7 
 
 
364 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  37.7 
 
 
364 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  36.54 
 
 
365 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  34.41 
 
 
362 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  34.41 
 
 
362 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  37.68 
 
 
361 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  37.68 
 
 
361 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  37.68 
 
 
361 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  38.24 
 
 
363 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  38.24 
 
 
363 aa  45.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  38.24 
 
 
363 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  38.24 
 
 
363 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  38.24 
 
 
363 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  38.24 
 
 
363 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  38.24 
 
 
363 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  38.24 
 
 
363 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  38.18 
 
 
346 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  38.46 
 
 
366 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02112  isrso5-transposase protein  28.1 
 
 
333 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2959  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  37.31 
 
 
360 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  40.38 
 
 
363 aa  44.3  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  37.25 
 
 
387 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  37.25 
 
 
387 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  37.25 
 
 
387 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  39.62 
 
 
363 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04269  isrso5-transposase protein  36.67 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0749923  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  39.58 
 
 
340 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  40.38 
 
 
366 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  34 
 
 
363 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  34 
 
 
363 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  34 
 
 
363 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  32.89 
 
 
1336 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5511  hypothetical protein  43.4 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.27076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  39.62 
 
 
363 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  39.62 
 
 
363 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  36.73 
 
 
363 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  36.73 
 
 
363 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  36.73 
 
 
363 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  36.73 
 
 
363 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  42.31 
 
 
362 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  35.44 
 
 
370 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  40.38 
 
 
379 aa  42.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
359 aa  41.6  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
359 aa  41.6  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
359 aa  41.6  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
359 aa  41.6  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
359 aa  41.6  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
359 aa  41.6  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
359 aa  41.6  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.300606 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>