129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2959 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2959  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5033  putative transposase  63.28 
 
 		 193 aa  224  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0700761  normal  0.0166306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0239  putative transposase  63.28 
 
 		 193 aa  224  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6643  putative transposase  63.28 
 
 		 193 aa  224  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2033  putative transposase  63.28 
 
 		 193 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  33.56 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  32.17 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  31.72 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  31.72 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4771  putative transposase  31.52 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  33.11 
 
 		 363 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  31.71 
 
 		 363 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  33.11 
 
 		 363 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  33.11 
 
 		 363 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  33.11 
 
 		 363 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  33.11 
 
 		 363 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  33.11 
 
 		 363 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  31.9 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  35.03 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  35.03 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  35.03 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2127  putative transposase  33.78 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1237  putative transposase  32.65 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3419  putative transposase  31.65 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.963439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  31.77 
 
 		 391 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0725  Transposase-like protein  24.64 
 
 		 327 aa  51.6  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.234146  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2203  Integrase catalytic region  24.64 
 
 		 327 aa  51.6  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0140131  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  30.34 
 
 		 362 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  30.34 
 
 		 389 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3263  hypothetical protein  29.73 
 
 		 376 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  29.66 
 
 		 362 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  29.66 
 
 		 362 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9055  hypothetical protein  27.22 
 
 		 373 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0723  Integrase catalytic region  23.91 
 
 		 327 aa  49.7  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  26.63 
 
 		 365 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3961  putative transposase  27.56 
 
 		 341 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  25.77 
 
 		 364 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  26.67 
 
 		 366 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  30.26 
 
 		 362 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  30.26 
 
 		 362 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  30.26 
 
 		 362 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  30.26 
 
 		 362 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1872  IS630 family transposase  30.5 
 
 		 376 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.226445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3014  hypothetical protein  25.15 
 
 		 311 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2523  putative transposase  28.83 
 
 		 285 aa  46.6  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4503  hypothetical protein  28.83 
 
 		 253 aa  46.2  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  26.22 
 
 		 363 aa  46.2  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  30.26 
 
 		 340 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  30.5 
 
 		 365 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4224  hypothetical protein  40.35 
 
 		 141 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.291894  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4638  hypothetical protein  40.35 
 
 		 141 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  28.47 
 
 		 346 aa  45.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  28.83 
 
 		 351 aa  45.8  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  28.83 
 
 		 351 aa  45.8  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0873  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000393117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2061  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.205919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4258  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0779487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4835  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4916  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.362826 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  32.89 
 
 		 311 aa  45.4  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  28.48 
 
 		 363 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  28.48 
 
 		 363 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  28.48 
 
 		 363 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1919  hypothetical protein  27.61 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  32.84 
 
 		 374 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  26.7 
 
 		 364 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  26.7 
 
 		 364 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  26.7 
 
 		 364 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  26.7 
 
 		 364 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  26.7 
 
 		 364 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  26.7 
 
 		 364 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  26.7 
 
 		 364 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  26.7 
 
 		 364 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  26.7 
 
 		 364 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0520  hypothetical protein  27.61 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  25.34 
 
 		 346 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  26.35 
 
 		 364 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1258  IS630 family transposase  27.61 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3067  IS630 family transposase  27.61 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0788  putative transposase  27.59 
 
 		 133 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  29.01 
 
 		 357 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  29.01 
 
 		 357 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3748  putative transposase  28.57 
 
 		 151 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4216  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0960652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  29.01 
 
 		 357 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  30.3 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  30.3 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  30.3 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2606  hypothetical protein  44 
 
 		 134 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  29.01 
 
 		 357 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  52.54 
 
 		 365 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  30.52 
 
 		 363 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  29.01 
 
 		 357 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.64 
 
 		 349 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  26.83 
 
 		 363 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  26.83 
 
 		 363 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  26.83 
 
 		 363 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2700  hypothetical protein  38.36 
 
 		 149 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3129  transposase of IS653-like element  27.78 
 
 		 187 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>