141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4224 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4224  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.291894  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4638  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  100 
 
 		 354 aa  192  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  94.51 
 
 		 356 aa  179  9.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  94.51 
 
 		 356 aa  179  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4170  hypothetical protein  90 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0508768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  43.59 
 
 		 346 aa  77  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  44.44 
 
 		 376 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  46.43 
 
 		 370 aa  63.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  39.47 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0064  hypothetical protein  44.05 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  40.24 
 
 		 363 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  40.24 
 
 		 363 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  40.24 
 
 		 363 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  40.24 
 
 		 363 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  40.24 
 
 		 363 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  43.53 
 
 		 387 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  43.53 
 
 		 387 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  43.53 
 
 		 387 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  40.24 
 
 		 363 aa  60.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  46.15 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  40.51 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  43.21 
 
 		 360 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  40.74 
 
 		 362 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  40.74 
 
 		 362 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  40.74 
 
 		 362 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  45.95 
 
 		 374 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  38.71 
 
 		 389 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  41.25 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  39.29 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  41.25 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  41.25 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  38.96 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  38.1 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  38.37 
 
 		 355 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  52.94 
 
 		 754 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  38.96 
 
 		 363 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  39.74 
 
 		 366 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  34.15 
 
 		 346 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04270  isrso5-transposase protein  38.55 
 
 		 243 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  38.55 
 
 		 242 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  37.33 
 
 		 370 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  37.33 
 
 		 370 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  37.33 
 
 		 367 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  37.33 
 
 		 370 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0513  transposase  37.5 
 
 		 287 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02112  isrso5-transposase protein  38.55 
 
 		 333 aa  50.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  33.09 
 
 		 1336 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  37.33 
 
 		 367 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0788  putative transposase  43.64 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2535  transposase, putative  37.8 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  38.46 
 
 		 363 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  38.46 
 
 		 363 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  38.46 
 
 		 363 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  39.47 
 
 		 362 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  39.47 
 
 		 362 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  39.47 
 
 		 362 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  39.47 
 
 		 362 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  39.47 
 
 		 362 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  39.47 
 
 		 362 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  36.36 
 
 		 363 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5437  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  40 
 
 		 300 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4459  transposase, putative  36.59 
 
 		 365 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  38.96 
 
 		 356 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  37.5 
 
 		 364 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  37.5 
 
 		 364 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  37.5 
 
 		 364 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  37.5 
 
 		 364 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  37.5 
 
 		 364 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  37.5 
 
 		 364 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  37.5 
 
 		 364 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  37.5 
 
 		 364 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  37.5 
 
 		 364 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  34.67 
 
 		 362 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 		 626 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  35.8 
 
 		 356 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  35.8 
 
 		 356 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  35.8 
 
 		 356 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  38.16 
 
 		 364 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2463  LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 423 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  34.67 
 
 		 340 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4308  hypothetical protein  36.47 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0140244  normal  0.688879 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  34.67 
 
 		 362 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  34.67 
 
 		 362 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  34.67 
 
 		 362 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  34.67 
 
 		 362 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  40.54 
 
 		 361 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  40.54 
 
 		 361 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  45.76 
 
 		 373 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  31.33 
 
 		 361 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  31.33 
 
 		 361 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  31.33 
 
 		 361 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  38.67 
 
 		 357 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5511  hypothetical protein  37.04 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.27076 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  35.9 
 
 		 364 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0966  transposase  42.31 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281851  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  38.67 
 
 		 357 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2959  hypothetical protein  40.35 
 
 		 220 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  38.67 
 
 		 357 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  38.67 
 
 		 357 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>