181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2535 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2535  transposase, putative  100 
 
 		 124 aa  245  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4459  transposase, putative  95.16 
 
 		 365 aa  239  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2605  transposase, putative  78.23 
 
 		 165 aa  193  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  35.59 
 
 		 366 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  40.32 
 
 		 363 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  40.32 
 
 		 363 aa  68.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  39.52 
 
 		 363 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  39.52 
 
 		 363 aa  67  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  39.37 
 
 		 362 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  39.52 
 
 		 363 aa  67  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  39.37 
 
 		 362 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  39.37 
 
 		 362 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  39.37 
 
 		 362 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  39.37 
 
 		 362 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  39.37 
 
 		 362 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  39.52 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  40.5 
 
 		 361 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  40.5 
 
 		 361 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  40.5 
 
 		 361 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  35.48 
 
 		 363 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  35.48 
 
 		 363 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  35.48 
 
 		 363 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  30 
 
 		 362 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  33.06 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  34.43 
 
 		 363 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  34.43 
 
 		 363 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 359 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 359 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 359 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 359 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 359 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 359 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 359 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 359 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 359 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 359 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 359 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 359 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 359 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 359 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 359 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  34.43 
 
 		 363 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  33.33 
 
 		 346 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  36.44 
 
 		 363 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  35.77 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  35.77 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  35.77 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  37.01 
 
 		 362 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  35.77 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  35.04 
 
 		 356 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  35.77 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  35.04 
 
 		 356 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  36.61 
 
 		 370 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  37.01 
 
 		 362 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  36.29 
 
 		 363 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  37.01 
 
 		 362 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  37.01 
 
 		 389 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  35.29 
 
 		 346 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  41.13 
 
 		 363 aa  57  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  41.13 
 
 		 363 aa  57  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  41.13 
 
 		 363 aa  57  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  41.13 
 
 		 363 aa  57  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  41.13 
 
 		 363 aa  57  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  41.13 
 
 		 363 aa  57  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  41.13 
 
 		 363 aa  57  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  36.92 
 
 		 387 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  36.92 
 
 		 387 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  36.92 
 
 		 387 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0453  remnant of ISRSO5 transposase protein  41.13 
 
 		 194 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405912 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  41.13 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  28.33 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  32.81 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  28.33 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  32.79 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  37.1 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  40.5 
 
 		 1336 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  36.29 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  32.81 
 
 		 626 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  37.19 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  32.52 
 
 		 365 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  33.86 
 
 		 365 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  34.19 
 
 		 354 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  33.33 
 
 		 362 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  33.33 
 
 		 362 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  33.33 
 
 		 362 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  33.33 
 
 		 340 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  33.33 
 
 		 362 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  34.45 
 
 		 366 aa  54.7  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5437  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  33.59 
 
 		 300 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  29.41 
 
 		 357 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  29.41 
 
 		 357 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  29.41 
 
 		 357 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  29.41 
 
 		 357 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  29.41 
 
 		 357 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0788  putative transposase  36.36 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  32.52 
 
 		 361 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  32.52 
 
 		 361 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4224  hypothetical protein  37.8 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.291894  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4638  hypothetical protein  37.8 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  37.11 
 
 		 375 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>