181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0788 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0788  putative transposase  100 
 
 
133 aa  269  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  53.08 
 
 
354 aa  136  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  52.27 
 
 
356 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  52.27 
 
 
356 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  39.85 
 
 
363 aa  96.3  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  38.35 
 
 
363 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  38.35 
 
 
363 aa  91.3  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  38.35 
 
 
363 aa  90.9  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  38.35 
 
 
363 aa  90.9  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  38.35 
 
 
363 aa  90.5  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  39.69 
 
 
375 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  39.85 
 
 
361 aa  83.6  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  39.85 
 
 
361 aa  83.6  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  36.84 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  37.31 
 
 
362 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  37.31 
 
 
389 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  36.57 
 
 
362 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  39.55 
 
 
363 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  39.55 
 
 
363 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  39.55 
 
 
363 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  36.57 
 
 
362 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  34.59 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  36.84 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  36.64 
 
 
363 aa  77  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  36.09 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  36.09 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  36.09 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  36.09 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  36.09 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  36.09 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  36.09 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  38.81 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  34.35 
 
 
361 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  35.38 
 
 
362 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  34.35 
 
 
361 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  35.34 
 
 
364 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  34.35 
 
 
361 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  37.12 
 
 
346 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  33.83 
 
 
363 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  33.83 
 
 
363 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  33.83 
 
 
363 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  36.69 
 
 
370 aa  74.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  35.34 
 
 
366 aa  73.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  34.85 
 
 
357 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  34.85 
 
 
357 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  34.85 
 
 
357 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  34.85 
 
 
357 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  34.85 
 
 
357 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  35.38 
 
 
362 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  35.38 
 
 
367 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  35.38 
 
 
362 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  35.34 
 
 
356 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  35.38 
 
 
370 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  35.38 
 
 
370 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  35.38 
 
 
367 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  35.38 
 
 
370 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  33.08 
 
 
365 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  35.38 
 
 
362 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  35.38 
 
 
362 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  35.38 
 
 
362 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  35.38 
 
 
362 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  33.08 
 
 
355 aa  70.5  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  33.85 
 
 
366 aa  70.5  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  35.38 
 
 
340 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  37.31 
 
 
373 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  35.34 
 
 
359 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  36.64 
 
 
626 aa  68.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  36.64 
 
 
363 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5437  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  34.59 
 
 
300 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218978  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  38.02 
 
 
363 aa  67.4  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  38.02 
 
 
363 aa  67.4  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  38.02 
 
 
363 aa  67.4  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  38.02 
 
 
363 aa  67.4  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  38.02 
 
 
363 aa  67.4  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  38.02 
 
 
363 aa  67.4  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  38.02 
 
 
363 aa  67.4  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  38.02 
 
 
363 aa  67.4  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0453  remnant of ISRSO5 transposase protein  38.02 
 
 
194 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.405912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  33.08 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  33.58 
 
 
362 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  33.58 
 
 
362 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  33.58 
 
 
362 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  33.58 
 
 
362 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  33.58 
 
 
362 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  33.58 
 
 
362 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  32.33 
 
 
364 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8357  putative transposase  35.11 
 
 
356 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  32.12 
 
 
364 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  33.08 
 
 
364 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  33.08 
 
 
364 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  33.08 
 
 
364 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  33.08 
 
 
364 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  33.08 
 
 
364 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  33.08 
 
 
364 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  33.08 
 
 
364 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  33.08 
 
 
364 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  33.08 
 
 
364 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3014  hypothetical protein  32.06 
 
 
311 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04270  isrso5-transposase protein  31.54 
 
 
243 aa  61.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  31.54 
 
 
242 aa  61.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>