201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04270 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04270  isrso5-transposase protein  100 
 
 
243 aa  502  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  97.53 
 
 
242 aa  483  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02112  isrso5-transposase protein  98.7 
 
 
333 aa  467  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  63.04 
 
 
363 aa  304  6e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  65.37 
 
 
363 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  65.37 
 
 
363 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  65.37 
 
 
363 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  65.37 
 
 
363 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  65.37 
 
 
363 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  65.37 
 
 
363 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  65.37 
 
 
363 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  62.77 
 
 
363 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  62.77 
 
 
363 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  62.77 
 
 
363 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  64.94 
 
 
363 aa  298  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  65.42 
 
 
375 aa  296  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  60.7 
 
 
360 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  57.27 
 
 
363 aa  262  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  55.11 
 
 
362 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  55.07 
 
 
367 aa  248  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  54.63 
 
 
370 aa  245  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  54.63 
 
 
370 aa  245  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  54.63 
 
 
367 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  54.19 
 
 
370 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  53.51 
 
 
365 aa  241  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  53.62 
 
 
374 aa  238  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  53.33 
 
 
362 aa  236  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  53.33 
 
 
362 aa  236  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  53.71 
 
 
366 aa  234  9e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  52.42 
 
 
362 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  52.42 
 
 
362 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  52.42 
 
 
362 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  52.42 
 
 
362 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  51.98 
 
 
340 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0453  remnant of ISRSO5 transposase protein  62.16 
 
 
194 aa  224  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.405912 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  50.45 
 
 
361 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  50.45 
 
 
361 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  48.21 
 
 
363 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  48.21 
 
 
363 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  48.9 
 
 
362 aa  219  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  48.21 
 
 
363 aa  219  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  50.22 
 
 
362 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  48.21 
 
 
363 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  48.21 
 
 
363 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  48.21 
 
 
363 aa  218  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  49.56 
 
 
389 aa  218  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  51.34 
 
 
363 aa  218  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  49.78 
 
 
362 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  49.78 
 
 
362 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  46.96 
 
 
366 aa  217  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  51.34 
 
 
626 aa  216  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  50 
 
 
356 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  50.43 
 
 
357 aa  215  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  50.43 
 
 
357 aa  215  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  50.43 
 
 
357 aa  215  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  50.43 
 
 
357 aa  215  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  50.43 
 
 
357 aa  215  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  49.12 
 
 
364 aa  208  6e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  50.88 
 
 
359 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  50.88 
 
 
359 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  50.88 
 
 
359 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  50.88 
 
 
359 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  50.88 
 
 
359 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  50.88 
 
 
359 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  50.88 
 
 
359 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  50.88 
 
 
359 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  50.88 
 
 
359 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  50.88 
 
 
359 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  50.88 
 
 
359 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  50.88 
 
 
359 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  50.88 
 
 
359 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  50.88 
 
 
359 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  50.88 
 
 
359 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  50.88 
 
 
363 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  49.34 
 
 
362 aa  204  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  49.34 
 
 
362 aa  204  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  49.34 
 
 
362 aa  204  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  49.34 
 
 
362 aa  204  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  49.34 
 
 
362 aa  204  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  49.34 
 
 
362 aa  204  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  46.02 
 
 
363 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  46.02 
 
 
363 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  46.02 
 
 
363 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  45.18 
 
 
361 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  45.18 
 
 
361 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  45.18 
 
 
361 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  41.22 
 
 
355 aa  189  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  44 
 
 
346 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  46.9 
 
 
365 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  45.54 
 
 
364 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  46.02 
 
 
370 aa  176  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  44.55 
 
 
366 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  45 
 
 
359 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  43.4 
 
 
364 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  44.6 
 
 
364 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  44.6 
 
 
364 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  44.6 
 
 
364 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  44.6 
 
 
364 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  44.6 
 
 
364 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  44.6 
 
 
364 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>