113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4308 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4308  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0140244  normal  0.688879 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0966  transposase  47.17 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281851  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  41.03 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  46 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2625  transposase  40.16 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0074  transposase  39.37 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.509194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1012  transposase  38.39 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1252  transposase  38.58 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  39.39 
 
 		 376 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0539  transposase  33.86 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1467  transposase  37.04 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4725  transposase  37.6 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2900  transposase  37.6 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.020589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2996  transposase  37.6 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.277448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4009  transposase  37.6 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.275389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1478  transposase  37.38 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4506  transposase  36 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  32.73 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  35.42 
 
 		 363 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13510  transposase  37.14 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13600  transposase  37.14 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16510  transposase  37.14 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20700  transposase  37.14 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24580  transposase  37.14 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25480  transposase  37.14 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30780  transposase  37.14 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41580  transposase  37.14 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49710  transposase  37.14 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  37.7 
 
 		 361 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  37.7 
 
 		 361 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  33.68 
 
 		 346 aa  50.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  36.59 
 
 		 363 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  36.36 
 
 		 363 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  36.36 
 
 		 363 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  36.36 
 
 		 363 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  36.59 
 
 		 363 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  36.59 
 
 		 363 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0630  hypothetical protein  36.46 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  36.59 
 
 		 363 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  37.14 
 
 		 387 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  37.14 
 
 		 387 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  37.14 
 
 		 387 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  36.59 
 
 		 363 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  31.13 
 
 		 346 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4435  transposase  30.56 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2935  hypothetical protein  35.29 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  36.47 
 
 		 354 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  34.78 
 
 		 364 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  34.57 
 
 		 377 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  34.45 
 
 		 366 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4224  hypothetical protein  36.47 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.291894  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4638  hypothetical protein  36.47 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  35.16 
 
 		 362 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  35.16 
 
 		 362 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  35.16 
 
 		 362 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  35.16 
 
 		 362 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  27.59 
 
 		 361 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  27.59 
 
 		 361 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  27.59 
 
 		 361 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  35.04 
 
 		 363 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  33.67 
 
 		 356 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  33.67 
 
 		 356 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  33.67 
 
 		 356 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  35.16 
 
 		 340 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  35.04 
 
 		 363 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  34.69 
 
 		 363 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  35.04 
 
 		 363 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  29.17 
 
 		 359 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  34.69 
 
 		 626 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  33 
 
 		 362 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2463  LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 423 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0774  transposase  29.17 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  31.09 
 
 		 363 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  34.69 
 
 		 356 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  32 
 
 		 362 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  32 
 
 		 362 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  34.83 
 
 		 365 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  36.36 
 
 		 362 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  27.16 
 
 		 377 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  32.61 
 
 		 360 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  39.66 
 
 		 356 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  31.87 
 
 		 367 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  39.66 
 
 		 356 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  31.87 
 
 		 367 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  31.87 
 
 		 370 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  36.9 
 
 		 362 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  36.9 
 
 		 362 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  36.9 
 
 		 362 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  36.9 
 
 		 362 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  36.9 
 
 		 362 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  36.9 
 
 		 362 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0063  hypothetical protein  46.81 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  27.16 
 
 		 377 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  32.58 
 
 		 370 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  27.16 
 
 		 377 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6643  putative transposase  37.5 
 
 		 193 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  27.16 
 
 		 377 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  27.16 
 
 		 377 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  27.16 
 
 		 377 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  27.16 
 
 		 377 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>