36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4725 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4725  transposase  100 
 
 		 157 aa  321  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2900  transposase  100 
 
 		 157 aa  321  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.020589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2996  transposase  100 
 
 		 157 aa  321  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.277448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4009  transposase  100 
 
 		 157 aa  321  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.275389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4506  transposase  91.08 
 
 		 157 aa  291  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25480  transposase  58.6 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13510  transposase  58.6 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13600  transposase  58.6 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16510  transposase  58.6 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20700  transposase  58.6 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24580  transposase  58.6 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30780  transposase  58.6 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41580  transposase  58.6 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49710  transposase  58.6 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0074  transposase  54.14 
 
 		 157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.509194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1252  transposase  56.05 
 
 		 157 aa  177  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2625  transposase  55.77 
 
 		 158 aa  175  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1467  transposase  53.5 
 
 		 157 aa  174  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0539  transposase  50.32 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1478  transposase  48.55 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0063  hypothetical protein  52.08 
 
 		 97 aa  98.2  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0966  transposase  40.43 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  38.16 
 
 		 375 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  38.16 
 
 		 390 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0630  hypothetical protein  36.77 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0774  transposase  35.53 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2935  hypothetical protein  35.81 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4435  transposase  31.45 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1012  transposase  33.11 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4308  hypothetical protein  37.6 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0140244  normal  0.688879 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28040  transposase  45.45 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  30.58 
 
 		 357 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  30.58 
 
 		 357 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  30.58 
 
 		 357 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  30.58 
 
 		 357 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  30.58 
 
 		 357 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>