38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16510 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_24580  transposase  100 
 
 
157 aa  313  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49710  transposase  100 
 
 
157 aa  313  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20700  transposase  100 
 
 
157 aa  313  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41580  transposase  100 
 
 
157 aa  313  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30780  transposase  100 
 
 
157 aa  313  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25480  transposase  100 
 
 
157 aa  313  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13510  transposase  100 
 
 
157 aa  313  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13600  transposase  100 
 
 
157 aa  313  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16510  transposase  100 
 
 
157 aa  313  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4009  transposase  58.6 
 
 
157 aa  179  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.275389  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2996  transposase  58.6 
 
 
157 aa  179  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.277448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2900  transposase  58.6 
 
 
157 aa  179  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.020589 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4725  transposase  58.6 
 
 
157 aa  179  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4506  transposase  56.69 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1252  transposase  52.87 
 
 
157 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1467  transposase  51.59 
 
 
157 aa  168  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0539  transposase  50.32 
 
 
157 aa  167  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0074  transposase  51.59 
 
 
157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.509194  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2625  transposase  51.28 
 
 
158 aa  160  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1478  transposase  48.55 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0063  hypothetical protein  54.17 
 
 
97 aa  98.2  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28040  transposase  77.61 
 
 
63 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  39.31 
 
 
375 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0966  transposase  34.75 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281851  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  36.55 
 
 
390 aa  74.7  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0630  hypothetical protein  33.78 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1012  transposase  33.78 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2935  hypothetical protein  32.64 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0774  transposase  32.03 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4435  transposase  31.82 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4308  hypothetical protein  37.14 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0140244  normal  0.688879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  33.33 
 
 
376 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  30.34 
 
 
391 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  28.81 
 
 
366 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5437  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  28.93 
 
 
300 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218978  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  30.1 
 
 
354 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  27.35 
 
 
362 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  26.89 
 
 
363 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>