130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1012 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1012  transposase  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0966  transposase  46.09 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4435  transposase  34.75 
 
 		 147 aa  90.1  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0774  transposase  31.91 
 
 		 163 aa  84.3  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  33.85 
 
 		 390 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0630  hypothetical protein  36.3 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0539  transposase  33.58 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  33.85 
 
 		 375 aa  74.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0074  transposase  35.81 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.509194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1467  transposase  31.08 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4308  hypothetical protein  38.39 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0140244  normal  0.688879 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13510  transposase  33.78 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13600  transposase  33.78 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16510  transposase  33.78 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20700  transposase  33.78 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24580  transposase  33.78 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25480  transposase  33.78 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30780  transposase  33.78 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41580  transposase  33.78 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49710  transposase  33.78 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2625  transposase  36.57 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4725  transposase  33.11 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2900  transposase  33.11 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.020589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2996  transposase  33.11 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.277448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4009  transposase  33.11 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.275389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1252  transposase  33.11 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4506  transposase  31.08 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  36.36 
 
 		 346 aa  61.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  36.04 
 
 		 387 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  36.04 
 
 		 387 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  36.04 
 
 		 387 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  32.76 
 
 		 391 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  27.01 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  30.56 
 
 		 365 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  29.82 
 
 		 366 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  33.01 
 
 		 362 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  33.01 
 
 		 362 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8357  putative transposase  38.64 
 
 		 356 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  38.04 
 
 		 354 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  30.97 
 
 		 355 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  33.01 
 
 		 362 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  31.19 
 
 		 356 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  31.19 
 
 		 356 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  31.19 
 
 		 356 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  28.45 
 
 		 363 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  34.74 
 
 		 376 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1478  transposase  30 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  27.59 
 
 		 363 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  33.33 
 
 		 373 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  27.59 
 
 		 363 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  27.59 
 
 		 363 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  27.59 
 
 		 363 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  27.59 
 
 		 363 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  41.03 
 
 		 754 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  35.87 
 
 		 356 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  35.87 
 
 		 356 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  32.18 
 
 		 363 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  34.07 
 
 		 362 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  34.07 
 
 		 362 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  34.07 
 
 		 362 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  34.07 
 
 		 362 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  34.07 
 
 		 362 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  34.07 
 
 		 362 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  36.25 
 
 		 374 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  30.16 
 
 		 364 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  30.61 
 
 		 377 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  34.38 
 
 		 370 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6643  putative transposase  31.54 
 
 		 193 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5033  putative transposase  31.54 
 
 		 193 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0700761  normal  0.0166306 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2747  hypothetical protein  30.51 
 
 		 373 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  30.25 
 
 		 363 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4771  putative transposase  30.25 
 
 		 282 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0239  putative transposase  31.54 
 
 		 193 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  30.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2033  putative transposase  31.54 
 
 		 193 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  30.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  31.25 
 
 		 362 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0513  transposase  28.26 
 
 		 287 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  31.52 
 
 		 362 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  31.52 
 
 		 362 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  31.52 
 
 		 362 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  31.52 
 
 		 340 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  31.52 
 
 		 362 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  30.25 
 
 		 363 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  30.25 
 
 		 363 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  30.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  30.25 
 
 		 363 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  30.25 
 
 		 363 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  30.25 
 
 		 363 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  28.7 
 
 		 363 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  28.7 
 
 		 363 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  28.7 
 
 		 363 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  30.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  30.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  30.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  30.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  30.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  30.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  30.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  30.25 
 
 		 363 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>