233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3846 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3846  transposase  100 
 
 
375 aa  771    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  71.01 
 
 
390 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1560  transposase  71.94 
 
 
206 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0744528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1324  hypothetical protein  53.69 
 
 
205 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527658  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4505  transposase  49.77 
 
 
220 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1251  transposase  54.23 
 
 
205 aa  216  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4724  transposase  49.3 
 
 
220 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2901  transposase  49.3 
 
 
220 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2997  transposase  49.3 
 
 
220 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.894838  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4008  transposase  49.3 
 
 
220 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227773  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0773  transposase  48.39 
 
 
223 aa  209  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122901 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1466  transposase  49.76 
 
 
207 aa  208  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2698  transposase  64.2 
 
 
172 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0967  transposase  48.77 
 
 
207 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.805263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2626  transposase  49.18 
 
 
186 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0540  transposase  48.11 
 
 
187 aa  182  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0073  transposase  45.15 
 
 
186 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.748359  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0631  hypothetical protein  40.89 
 
 
215 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  30.95 
 
 
356 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  30.95 
 
 
356 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  30.95 
 
 
356 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1010  transposase  46.67 
 
 
146 aa  133  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  31.25 
 
 
355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  29.95 
 
 
391 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  28.29 
 
 
376 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  29.43 
 
 
346 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2934  putative transposase  45.99 
 
 
171 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  27.27 
 
 
377 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  28.2 
 
 
346 aa  123  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  26.54 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  26.54 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  28.65 
 
 
362 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  28.65 
 
 
389 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  28.65 
 
 
362 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  28.65 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  29.43 
 
 
363 aa  119  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  29.43 
 
 
363 aa  119  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  29.17 
 
 
364 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  29.43 
 
 
363 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  26.27 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  29.13 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  26.27 
 
 
377 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  29.13 
 
 
363 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  26.27 
 
 
377 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  26.27 
 
 
377 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  26.27 
 
 
377 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  26.27 
 
 
377 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  26.27 
 
 
377 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  26.27 
 
 
377 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  26.27 
 
 
377 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  29.13 
 
 
363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1872  IS630 family transposase  28.65 
 
 
376 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.226445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  28.65 
 
 
365 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  29.06 
 
 
356 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  28.88 
 
 
362 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  28.88 
 
 
362 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  28.88 
 
 
362 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  28.88 
 
 
362 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  28.88 
 
 
362 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  28.88 
 
 
362 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  29.66 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  28.78 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  28.78 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  28.78 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  25.15 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  28.44 
 
 
365 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  24.23 
 
 
361 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  29.17 
 
 
354 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  24.23 
 
 
361 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  24.23 
 
 
361 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  28.93 
 
 
363 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  26.69 
 
 
359 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  28.93 
 
 
363 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  28.93 
 
 
363 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  28.93 
 
 
363 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2163  transposase  46.53 
 
 
105 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281917  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  28.8 
 
 
363 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  26.43 
 
 
367 aa  107  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  29.72 
 
 
370 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  26.43 
 
 
367 aa  106  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  28.8 
 
 
363 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  28.8 
 
 
363 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  25.46 
 
 
364 aa  106  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  27.09 
 
 
370 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  28.99 
 
 
356 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  27.09 
 
 
370 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  30.3 
 
 
356 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  26.95 
 
 
370 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  28.84 
 
 
361 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  28.84 
 
 
361 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  26.24 
 
 
366 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  29.3 
 
 
366 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  27.25 
 
 
363 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  27.46 
 
 
360 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  28.25 
 
 
363 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  28.25 
 
 
363 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  27.7 
 
 
362 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  27.33 
 
 
363 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  27.72 
 
 
340 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  27.33 
 
 
626 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>