175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1251 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1251  transposase  100 
 
 		 205 aa  431  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1466  transposase  79.9 
 
 		 207 aa  353  1e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2626  transposase  80.43 
 
 		 186 aa  322  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0540  transposase  77.42 
 
 		 187 aa  314  7e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4724  transposase  65.2 
 
 		 220 aa  292  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2901  transposase  65.2 
 
 		 220 aa  292  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2997  transposase  65.2 
 
 		 220 aa  292  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.894838  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4008  transposase  65.2 
 
 		 220 aa  292  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0073  transposase  69.8 
 
 		 186 aa  287  9e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.748359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4505  transposase  64.68 
 
 		 220 aa  281  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  56.25 
 
 		 390 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0967  transposase  51.49 
 
 		 207 aa  224  9e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.805263  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  54.23 
 
 		 375 aa  216  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1324  hypothetical protein  50 
 
 		 205 aa  211  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527658  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1560  transposase  55.15 
 
 		 206 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0631  hypothetical protein  44.55 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0773  transposase  44.39 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122901 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0065  transposase  87.21 
 
 		 90 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0064  transposase  80 
 
 		 105 aa  159  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2163  transposase  65.38 
 
 		 105 aa  151  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2698  transposase  45.91 
 
 		 172 aa  129  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1010  transposase  44.44 
 
 		 146 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2934  putative transposase  50.89 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2350  transposase  72.73 
 
 		 67 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00203316  normal  0.0195655 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  30.89 
 
 		 377 aa  91.3  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  30.89 
 
 		 377 aa  91.3  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  30.37 
 
 		 377 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  30.37 
 
 		 377 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  30.37 
 
 		 377 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  30.37 
 
 		 377 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  30.37 
 
 		 377 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  30.37 
 
 		 377 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  30.37 
 
 		 377 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  30.37 
 
 		 377 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  30.37 
 
 		 377 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  28.57 
 
 		 377 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  28.65 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  28.89 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  26.19 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  26.19 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  26.19 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  26.19 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  26.19 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  26.19 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  27.93 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  26.26 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  28.64 
 
 		 359 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  27.63 
 
 		 376 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  25.13 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0747  hypothetical protein  27.91 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  30.07 
 
 		 363 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  25.87 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  23.89 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  25.47 
 
 		 362 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  25.47 
 
 		 362 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  25.47 
 
 		 362 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  25.47 
 
 		 389 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  26.53 
 
 		 391 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4459  transposase, putative  25.87 
 
 		 365 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0804  hypothetical protein  46.88 
 
 		 64 aa  64.3  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  25.91 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  30.56 
 
 		 583 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  30.14 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  27.27 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  24.12 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2484  putative transposase  22.99 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.350833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  24.75 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  25.37 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  25.37 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  25.37 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  30.14 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  30.14 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  26.57 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  26.57 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  23.37 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  25.41 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  25.41 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  27.17 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  27.17 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  25.37 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  26.8 
 
 		 379 aa  62.4  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  25.41 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  25.84 
 
 		 363 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  23.76 
 
 		 351 aa  62  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  25.41 
 
 		 363 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  25.41 
 
 		 363 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  29.86 
 
 		 363 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  29.86 
 
 		 363 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  26.29 
 
 		 363 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  26.38 
 
 		 357 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  26.38 
 
 		 357 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  26.38 
 
 		 357 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  26.38 
 
 		 357 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  26.38 
 
 		 357 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  28.31 
 
 		 356 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  28.66 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  28.66 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  28.66 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  28.66 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  28.66 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>