177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2698 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2698  transposase  100 
 
 
172 aa  355  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  64.2 
 
 
375 aa  221  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  62.96 
 
 
390 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1560  transposase  62.76 
 
 
206 aa  186  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0744528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1324  hypothetical protein  55.49 
 
 
205 aa  185  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527658  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0967  transposase  42.07 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.805263  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0773  transposase  43.86 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122901 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1251  transposase  45.91 
 
 
205 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4505  transposase  44.51 
 
 
220 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4724  transposase  43.83 
 
 
220 aa  134  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2901  transposase  43.83 
 
 
220 aa  134  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2997  transposase  43.83 
 
 
220 aa  134  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.894838  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4008  transposase  43.83 
 
 
220 aa  134  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227773  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1466  transposase  42.59 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0631  hypothetical protein  39.63 
 
 
215 aa  117  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0540  transposase  42.25 
 
 
187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2626  transposase  41.84 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0073  transposase  37.04 
 
 
186 aa  108  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.748359  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2934  putative transposase  38.57 
 
 
171 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1010  transposase  45.65 
 
 
146 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  31.11 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0064  transposase  45.24 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  31.72 
 
 
359 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  31.72 
 
 
359 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  31.72 
 
 
359 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  31.72 
 
 
359 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  31.72 
 
 
359 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  31.72 
 
 
359 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  31.72 
 
 
359 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  31.72 
 
 
359 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  31.72 
 
 
359 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  31.72 
 
 
359 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  31.72 
 
 
359 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  31.41 
 
 
363 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  31.72 
 
 
359 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  31.72 
 
 
359 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  31.72 
 
 
359 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  31.72 
 
 
359 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  31.74 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  31.74 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  31.74 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  33.73 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  33.73 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  33.73 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  33.73 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  33.73 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  33.73 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  31.74 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  29.05 
 
 
361 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  29.05 
 
 
361 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  29.05 
 
 
361 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  32.03 
 
 
362 aa  68.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  32.03 
 
 
362 aa  68.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  31.45 
 
 
366 aa  67.4  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4459  transposase, putative  30 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  33.33 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  29.81 
 
 
363 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  29.81 
 
 
363 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  32 
 
 
370 aa  65.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  29.81 
 
 
363 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  29.81 
 
 
363 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  29.56 
 
 
583 aa  65.1  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  31.21 
 
 
365 aa  65.1  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  28.29 
 
 
370 aa  64.7  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  28.29 
 
 
370 aa  64.7  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  31.72 
 
 
361 aa  64.7  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  31.72 
 
 
361 aa  64.7  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  28.29 
 
 
367 aa  64.3  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  32.68 
 
 
362 aa  64.3  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  29.33 
 
 
359 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  29.56 
 
 
363 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  29.56 
 
 
363 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  28.29 
 
 
367 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  29.56 
 
 
363 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  27.78 
 
 
364 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  27.78 
 
 
364 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  28.29 
 
 
370 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  27.78 
 
 
364 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  27.78 
 
 
364 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  27.78 
 
 
364 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  27.78 
 
 
364 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  27.78 
 
 
364 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  27.78 
 
 
364 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  27.78 
 
 
364 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  33.09 
 
 
377 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  34.21 
 
 
364 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  27.16 
 
 
364 aa  61.6  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  28.98 
 
 
366 aa  61.6  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  29.38 
 
 
363 aa  61.2  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  29.38 
 
 
363 aa  61.2  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0065  transposase  43.94 
 
 
90 aa  61.2  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  31.03 
 
 
356 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  27.74 
 
 
355 aa  60.8  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  31.29 
 
 
363 aa  60.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  31.29 
 
 
626 aa  60.8  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  28.75 
 
 
363 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  28.75 
 
 
363 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  29.01 
 
 
364 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  28.07 
 
 
366 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  28.75 
 
 
363 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>