181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0540 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0540  transposase  100 
 
 		 187 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1466  transposase  85.56 
 
 		 207 aa  333  7e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1251  transposase  77.42 
 
 		 205 aa  314  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2626  transposase  72.83 
 
 		 186 aa  293  9e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4724  transposase  61.41 
 
 		 220 aa  250  8.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2901  transposase  61.41 
 
 		 220 aa  250  8.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2997  transposase  61.41 
 
 		 220 aa  250  8.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.894838  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4008  transposase  61.41 
 
 		 220 aa  250  8.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4505  transposase  60.33 
 
 		 220 aa  244  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0073  transposase  62.5 
 
 		 186 aa  230  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.748359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1560  transposase  52.38 
 
 		 206 aa  197  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  51.85 
 
 		 390 aa  197  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0967  transposase  47.31 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.805263  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  48.11 
 
 		 375 aa  182  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1324  hypothetical protein  42.62 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527658  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0773  transposase  45.36 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122901 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0065  transposase  81.82 
 
 		 90 aa  158  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0631  hypothetical protein  43.58 
 
 		 215 aa  147  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2163  transposase  64.76 
 
 		 105 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1010  transposase  44.44 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0064  transposase  79.17 
 
 		 105 aa  121  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2698  transposase  42.25 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2350  transposase  65.15 
 
 		 67 aa  95.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00203316  normal  0.0195655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2934  putative transposase  50.53 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  31.29 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  30.99 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  30.99 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  31.29 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  30.99 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  30.99 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  30.99 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  30.99 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  30.99 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  30.99 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  30.99 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  29.38 
 
 		 377 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  26.59 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  26.59 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  26.59 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  26.59 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  26.59 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  26.59 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  27.49 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  26.97 
 
 		 376 aa  68.2  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4459  transposase, putative  24.56 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0804  hypothetical protein  46.88 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  28.57 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  26.51 
 
 		 370 aa  65.5  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  25.7 
 
 		 366 aa  65.5  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  25.71 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  25.71 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  25.71 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  26.62 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  25.71 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  25 
 
 		 379 aa  62.4  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  24.7 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  25.97 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  25.44 
 
 		 374 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  29.27 
 
 		 363 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  26.79 
 
 		 363 aa  62  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  26.79 
 
 		 363 aa  62  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  26.79 
 
 		 363 aa  61.6  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  26.79 
 
 		 363 aa  61.6  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  26.79 
 
 		 363 aa  61.6  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  21.47 
 
 		 356 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  26.79 
 
 		 363 aa  61.2  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  27.27 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  27.27 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  27.27 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  27.27 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  27.27 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  25.32 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  26.25 
 
 		 626 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  25 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  25 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  25 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  28.46 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  25.58 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  20.79 
 
 		 353 aa  58.9  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  28.46 
 
 		 363 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  21.79 
 
 		 351 aa  58.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  28.46 
 
 		 363 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  21.67 
 
 		 353 aa  58.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  25.62 
 
 		 363 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  23.2 
 
 		 365 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  28.93 
 
 		 583 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2484  putative transposase  19.67 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.350833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  21.67 
 
 		 353 aa  57.8  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  28.1 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  19.89 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  25.45 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  28.1 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  28.1 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  24.85 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  24.85 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  22.22 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  22.89 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>