39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0065 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0065  transposase  100 
 
 
90 aa  192  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1251  transposase  87.21 
 
 
205 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1466  transposase  82.95 
 
 
207 aa  159  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0540  transposase  81.82 
 
 
187 aa  158  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2626  transposase  79.55 
 
 
186 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0073  transposase  76.14 
 
 
186 aa  143  8.000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.748359  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4505  transposase  70.45 
 
 
220 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4724  transposase  71.76 
 
 
220 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2901  transposase  71.76 
 
 
220 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2997  transposase  71.76 
 
 
220 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.894838  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4008  transposase  71.76 
 
 
220 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227773  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2163  transposase  63.75 
 
 
105 aa  111  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281917  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  57.14 
 
 
390 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1560  transposase  57.14 
 
 
206 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0744528 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0967  transposase  55.95 
 
 
207 aa  100  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.805263  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2350  transposase  69.7 
 
 
67 aa  99.4  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00203316  normal  0.0195655 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  50.59 
 
 
375 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1010  transposase  48.86 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1324  hypothetical protein  48.81 
 
 
205 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527658  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0773  transposase  51.19 
 
 
223 aa  87.8  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0631  hypothetical protein  46.51 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1050  transposase  45 
 
 
62 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2698  transposase  43.94 
 
 
172 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  32.58 
 
 
377 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  32.58 
 
 
377 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  32.58 
 
 
377 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  32.58 
 
 
377 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  32.58 
 
 
377 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  32.58 
 
 
377 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  32.58 
 
 
377 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  32.58 
 
 
377 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  32.58 
 
 
377 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  32.58 
 
 
377 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  32.58 
 
 
377 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  30.34 
 
 
377 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  40.32 
 
 
356 aa  43.5  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  40.32 
 
 
356 aa  43.5  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  40.32 
 
 
356 aa  43.5  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0804  hypothetical protein  47.5 
 
 
64 aa  40  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>