186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1324 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1324  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527658  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  57.14 
 
 		 390 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0967  transposase  52.94 
 
 		 207 aa  234  9e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.805263  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  53.69 
 
 		 375 aa  228  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4505  transposase  52.22 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4724  transposase  50.74 
 
 		 220 aa  215  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2901  transposase  50.74 
 
 		 220 aa  215  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2997  transposase  50.74 
 
 		 220 aa  215  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.894838  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4008  transposase  50.74 
 
 		 220 aa  215  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1251  transposase  50 
 
 		 205 aa  211  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1560  transposase  53.23 
 
 		 206 aa  205  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744528 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1466  transposase  46.8 
 
 		 207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2626  transposase  48.35 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0631  hypothetical protein  42.36 
 
 		 215 aa  176  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2698  transposase  55.49 
 
 		 172 aa  171  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0773  transposase  42.86 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122901 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0073  transposase  42.93 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.748359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0540  transposase  42.62 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1010  transposase  45.99 
 
 		 146 aa  136  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2934  putative transposase  50 
 
 		 171 aa  118  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2163  transposase  49 
 
 		 105 aa  112  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0065  transposase  48.81 
 
 		 90 aa  90.5  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0064  transposase  47.62 
 
 		 105 aa  85.5  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2350  transposase  56.72 
 
 		 67 aa  85.1  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00203316  normal  0.0195655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  32.62 
 
 		 362 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  32.62 
 
 		 362 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  32.62 
 
 		 362 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  32.62 
 
 		 389 aa  81.3  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  31.25 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  33.15 
 
 		 370 aa  79  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  35.23 
 
 		 355 aa  79  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  35.15 
 
 		 363 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  29.85 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  31.69 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  28.86 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  30.39 
 
 		 362 aa  72  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  30.39 
 
 		 362 aa  72  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  30.39 
 
 		 362 aa  72  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  30.39 
 
 		 362 aa  72  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  31.15 
 
 		 356 aa  72  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  30.39 
 
 		 362 aa  72  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  30.39 
 
 		 362 aa  72  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  29.41 
 
 		 351 aa  71.2  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  33.94 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  33.94 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  34.36 
 
 		 583 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  30 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  30 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  30 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  30 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  30 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  33.94 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  28.89 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  30.6 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  32.32 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  33.74 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  33.74 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  33.74 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  28.98 
 
 		 376 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  27.93 
 
 		 377 aa  68.2  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  30.39 
 
 		 365 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  28.36 
 
 		 351 aa  68.2  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  29.05 
 
 		 363 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  29.05 
 
 		 363 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  29.05 
 
 		 363 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  29.05 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  27.27 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  29.05 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  26.23 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  29.05 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2484  putative transposase  27.68 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.350833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  31.87 
 
 		 356 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  29.05 
 
 		 379 aa  64.7  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  29.52 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  27 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  27 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  29.45 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  29.45 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  26.47 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  27.78 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  27.78 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1050  transposase  45 
 
 		 62 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  27 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  27 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  27 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>