23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1050 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1050  transposase  100 
 
 
62 aa  128  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  51.67 
 
 
390 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1560  transposase  51.67 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0744528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1324  hypothetical protein  45 
 
 
205 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527658  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0967  transposase  50.88 
 
 
207 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.805263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2626  transposase  46.67 
 
 
186 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1251  transposase  48.33 
 
 
205 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  43.33 
 
 
375 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2163  transposase  45.9 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281917  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2350  transposase  46.43 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00203316  normal  0.0195655 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0773  transposase  50.98 
 
 
223 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122901 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4505  transposase  43.33 
 
 
220 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0631  hypothetical protein  41.67 
 
 
215 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1466  transposase  45 
 
 
207 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0065  transposase  45 
 
 
90 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0540  transposase  43.33 
 
 
187 aa  54.7  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0073  transposase  41.67 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.748359  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2997  transposase  41.67 
 
 
220 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.894838  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4008  transposase  41.67 
 
 
220 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227773  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2901  transposase  41.67 
 
 
220 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4724  transposase  41.67 
 
 
220 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1010  transposase  38.33 
 
 
146 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2698  transposase  48.98 
 
 
172 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>