172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1466 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1466  transposase  100 
 
 		 207 aa  432  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1251  transposase  79.9 
 
 		 205 aa  353  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0540  transposase  85.56 
 
 		 187 aa  333  7.999999999999999e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2626  transposase  72.83 
 
 		 186 aa  291  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4724  transposase  64.22 
 
 		 220 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2901  transposase  64.22 
 
 		 220 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2997  transposase  64.22 
 
 		 220 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.894838  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4008  transposase  64.22 
 
 		 220 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4505  transposase  64.22 
 
 		 220 aa  288  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0073  transposase  62.75 
 
 		 186 aa  259  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.748359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0967  transposase  51.94 
 
 		 207 aa  230  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.805263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  53.11 
 
 		 390 aa  223  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  49.76 
 
 		 375 aa  208  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1560  transposase  52.6 
 
 		 206 aa  201  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1324  hypothetical protein  46.8 
 
 		 205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527658  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0631  hypothetical protein  45.45 
 
 		 215 aa  184  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0773  transposase  43.84 
 
 		 223 aa  174  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122901 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0064  transposase  83.7 
 
 		 105 aa  160  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0065  transposase  82.95 
 
 		 90 aa  159  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2163  transposase  66.67 
 
 		 105 aa  149  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1010  transposase  45.83 
 
 		 146 aa  136  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2934  putative transposase  55.86 
 
 		 171 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2698  transposase  42.59 
 
 		 172 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2350  transposase  69.7 
 
 		 67 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00203316  normal  0.0195655 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  32.43 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  32.43 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  32.43 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  32.43 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  32.43 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  32.43 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  32.43 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  32.43 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  32.43 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  32.43 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  32.43 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  31.21 
 
 		 377 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  27.84 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4459  transposase, putative  25.4 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  28.1 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  27.98 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  28.16 
 
 		 364 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  26.42 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  27.62 
 
 		 583 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  30.06 
 
 		 363 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0804  hypothetical protein  46.88 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  30.06 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  30.06 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  27.37 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  27.14 
 
 		 363 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  29.81 
 
 		 363 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  29.81 
 
 		 363 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  27.41 
 
 		 362 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  27.41 
 
 		 362 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  27.41 
 
 		 362 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  27.41 
 
 		 362 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  27.41 
 
 		 362 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  27.41 
 
 		 362 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  28.77 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  27.27 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  27.27 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  26.67 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  25.84 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  25.27 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  26.57 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  26.57 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  25.84 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  26.67 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  25.84 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  26.29 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  26.29 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  26.67 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  26.29 
 
 		 389 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  26.29 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  24.31 
 
 		 357 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  24.31 
 
 		 357 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  24.31 
 
 		 357 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  24.31 
 
 		 357 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  24.31 
 
 		 357 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  24.49 
 
 		 391 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  26.09 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  26.09 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  26.09 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  23.63 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  28.08 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  25.11 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>