23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2350 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2350  transposase  100 
 
 		 67 aa  142  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00203316  normal  0.0195655 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2163  transposase  89.55 
 
 		 105 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4505  transposase  74.24 
 
 		 220 aa  113  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2997  transposase  72.73 
 
 		 220 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.894838  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4008  transposase  72.73 
 
 		 220 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2901  transposase  72.73 
 
 		 220 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4724  transposase  72.73 
 
 		 220 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1251  transposase  72.73 
 
 		 205 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2626  transposase  68.66 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1466  transposase  69.7 
 
 		 207 aa  100  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0073  transposase  70.15 
 
 		 186 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.748359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0065  transposase  69.7 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0540  transposase  65.15 
 
 		 187 aa  95.1  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1324  hypothetical protein  56.72 
 
 		 205 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527658  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0967  transposase  57.81 
 
 		 207 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.805263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1560  transposase  55.74 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  55.74 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1010  transposase  50 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  51.67 
 
 		 375 aa  73.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0631  hypothetical protein  50.79 
 
 		 215 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0773  transposase  44.44 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122901 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1050  transposase  46.43 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2698  transposase  44.83 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>