233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1402 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  100 
 
 		 390 aa  797    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  71.01 
 
 		 375 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1560  transposase  98.54 
 
 		 206 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1324  hypothetical protein  57.14 
 
 		 205 aa  239  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527658  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4724  transposase  53.27 
 
 		 220 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2901  transposase  53.27 
 
 		 220 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2997  transposase  53.27 
 
 		 220 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.894838  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4008  transposase  53.27 
 
 		 220 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1251  transposase  56.25 
 
 		 205 aa  229  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1466  transposase  53.11 
 
 		 207 aa  223  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4505  transposase  51.4 
 
 		 220 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0967  transposase  50.97 
 
 		 207 aa  211  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.805263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2626  transposase  54.59 
 
 		 186 aa  205  9e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0773  transposase  47.47 
 
 		 223 aa  199  9e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122901 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0540  transposase  51.85 
 
 		 187 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2698  transposase  62.96 
 
 		 172 aa  192  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0073  transposase  48.08 
 
 		 186 aa  189  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.748359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0631  hypothetical protein  42.72 
 
 		 215 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  30.29 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  30.9 
 
 		 376 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1010  transposase  46.72 
 
 		 146 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  29.15 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  30.03 
 
 		 391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  30.29 
 
 		 377 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  33.9 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  28.49 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  32.4 
 
 		 356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  32.4 
 
 		 356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  32.4 
 
 		 356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2934  putative transposase  42.51 
 
 		 171 aa  126  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  30.33 
 
 		 362 aa  124  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  31.76 
 
 		 362 aa  123  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  31.76 
 
 		 362 aa  123  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  31.76 
 
 		 389 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  31.76 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  26.19 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  29.6 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  29.15 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  28.25 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  28.25 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1872  IS630 family transposase  30.59 
 
 		 376 aa  119  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.226445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  30.59 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  28.84 
 
 		 363 aa  119  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  27 
 
 		 362 aa  119  9e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  27 
 
 		 362 aa  119  9e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  27.97 
 
 		 363 aa  119  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  30.84 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  30.84 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  30.84 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  28.84 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  30.11 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  31.03 
 
 		 370 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  26.32 
 
 		 367 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  31.32 
 
 		 363 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  28.27 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  28.27 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  27.19 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  31.04 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  26.13 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  30.19 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  26.13 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  31.04 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  31.04 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  26.13 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  27.6 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  31.04 
 
 		 363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  26.04 
 
 		 367 aa  113  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  30.77 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  30.77 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  25.63 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  27.89 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  26.93 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  26.93 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  27.89 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  27.89 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  27.89 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  27.89 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  27.89 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  27.89 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  27.89 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  27.89 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  26.63 
 
 		 356 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2163  transposase  48.54 
 
 		 105 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  28.57 
 
 		 362 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  28.57 
 
 		 362 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  28.57 
 
 		 362 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  28.57 
 
 		 362 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  28.57 
 
 		 362 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  28.57 
 
 		 362 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  29.19 
 
 		 366 aa  109  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  26.3 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  30.63 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  30.63 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  28.83 
 
 		 379 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  27.12 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  26.93 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  26.96 
 
 		 357 aa  106  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  26.96 
 
 		 357 aa  106  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  26.96 
 
 		 357 aa  106  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  26.96 
 
 		 357 aa  106  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>