190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1560 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1560  transposase  100 
 
 		 206 aa  427  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  98.54 
 
 		 390 aa  423  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  71.94 
 
 		 375 aa  301  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1251  transposase  55.15 
 
 		 205 aa  209  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1324  hypothetical protein  53.23 
 
 		 205 aa  205  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527658  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1466  transposase  52.6 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2626  transposase  53.51 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4724  transposase  52.94 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2901  transposase  52.94 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2997  transposase  52.94 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.894838  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4008  transposase  52.94 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0540  transposase  52.38 
 
 		 187 aa  197  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4505  transposase  50.8 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0967  transposase  48.68 
 
 		 207 aa  184  8e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.805263  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0773  transposase  47.64 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122901 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0073  transposase  46.6 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.748359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2698  transposase  62.76 
 
 		 172 aa  168  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0631  hypothetical protein  40.74 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1010  transposase  46.72 
 
 		 146 aa  138  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2163  transposase  49.51 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0065  transposase  57.14 
 
 		 90 aa  105  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2934  putative transposase  42.19 
 
 		 171 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  33.99 
 
 		 376 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  34.93 
 
 		 355 aa  85.9  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  36.99 
 
 		 364 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  33.59 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2350  transposase  55.74 
 
 		 67 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00203316  normal  0.0195655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  31.76 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  36.05 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  32.26 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  28.96 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  27.06 
 
 		 353 aa  75.9  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  27.65 
 
 		 351 aa  75.5  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  26.67 
 
 		 363 aa  74.7  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  31.72 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  31.72 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  34.25 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  31.72 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  34.25 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  34.25 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  29.08 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2484  putative transposase  29.08 
 
 		 194 aa  74.7  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.350833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  31.72 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  37.19 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  37.19 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  37.19 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  34.25 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  27.32 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  34.59 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  33.54 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  31.25 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  31.25 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  30.11 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  32.94 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  31.18 
 
 		 363 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  31.18 
 
 		 363 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  31.06 
 
 		 379 aa  72.4  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  30.43 
 
 		 583 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  29.26 
 
 		 365 aa  72  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  29.63 
 
 		 365 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  29.1 
 
 		 362 aa  71.2  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  29.1 
 
 		 362 aa  71.2  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  27.66 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  26.78 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  27.93 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  30.32 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  29.86 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  29.86 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  27.93 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  29.86 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  31.72 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  31.72 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  29.86 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  25.97 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  31.34 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  31.25 
 
 		 370 aa  68.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  31.25 
 
 		 370 aa  68.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  28.88 
 
 		 362 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  28.88 
 
 		 362 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  28.88 
 
 		 362 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  28.88 
 
 		 362 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  27.66 
 
 		 362 aa  68.6  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  27.66 
 
 		 362 aa  68.6  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  27.66 
 
 		 362 aa  68.6  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  27.66 
 
 		 362 aa  68.6  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>