More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2745 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  100 
 
 
376 aa  768    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  34.72 
 
 
346 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  37.91 
 
 
356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  37.91 
 
 
356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  37.91 
 
 
356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  36.13 
 
 
354 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  36.9 
 
 
367 aa  212  9e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  36.96 
 
 
370 aa  209  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  36.49 
 
 
365 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  36.62 
 
 
367 aa  209  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  36.87 
 
 
391 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  35.49 
 
 
362 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  35.49 
 
 
362 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  35.49 
 
 
362 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  35.49 
 
 
362 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  35.14 
 
 
346 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  35.06 
 
 
356 aa  206  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  37.25 
 
 
366 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  35.94 
 
 
363 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  35.94 
 
 
363 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  36.28 
 
 
363 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  34.77 
 
 
356 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  33.6 
 
 
389 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  33.71 
 
 
363 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  33.99 
 
 
362 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  35.55 
 
 
374 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  33.88 
 
 
362 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  33.71 
 
 
363 aa  204  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  33.88 
 
 
362 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  33.71 
 
 
363 aa  203  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  35.92 
 
 
361 aa  203  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  35.92 
 
 
361 aa  203  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  33.71 
 
 
363 aa  202  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  35.65 
 
 
363 aa  202  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  35.65 
 
 
363 aa  202  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  33.71 
 
 
363 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  35.99 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  35.65 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  34.84 
 
 
363 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  34.84 
 
 
363 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  34.84 
 
 
363 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  33.43 
 
 
363 aa  199  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  34.23 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  35.65 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  34.23 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  34.23 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  35.11 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  34.23 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  34.23 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  34.23 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  34.76 
 
 
364 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  33.96 
 
 
362 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  36.36 
 
 
366 aa  196  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  35.53 
 
 
363 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  32.79 
 
 
377 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  33.16 
 
 
366 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  35.53 
 
 
626 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  33.62 
 
 
362 aa  192  9e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  33.62 
 
 
362 aa  192  9e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  32 
 
 
355 aa  192  9e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  33.91 
 
 
362 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  35.09 
 
 
370 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  36.1 
 
 
359 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1872  IS630 family transposase  36.06 
 
 
376 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.226445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  36.06 
 
 
365 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  36.15 
 
 
370 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  36.15 
 
 
370 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  32.76 
 
 
359 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  32.76 
 
 
359 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  32.76 
 
 
359 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  32.76 
 
 
359 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  32.76 
 
 
359 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  32.76 
 
 
359 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  32.76 
 
 
359 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  32.76 
 
 
359 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  32.76 
 
 
359 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  32.76 
 
 
359 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  32.76 
 
 
359 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  32.76 
 
 
359 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  32.76 
 
 
359 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  32.76 
 
 
359 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  32.76 
 
 
359 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  33.82 
 
 
360 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  34.67 
 
 
364 aa  182  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  37.07 
 
 
373 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  32.29 
 
 
363 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  34.1 
 
 
361 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  34.1 
 
 
361 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  34.1 
 
 
361 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  31.71 
 
 
363 aa  179  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  30.57 
 
 
363 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  35.07 
 
 
387 aa  179  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  35.07 
 
 
387 aa  179  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  35.07 
 
 
387 aa  179  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  30.57 
 
 
363 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  30.57 
 
 
363 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  31.64 
 
 
357 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  31.64 
 
 
357 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  31.64 
 
 
357 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  31.64 
 
 
357 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>