45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1252 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1252  transposase  100 
 
 
157 aa  320  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1467  transposase  82.17 
 
 
157 aa  269  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0539  transposase  80.89 
 
 
157 aa  259  8e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1478  transposase  86.23 
 
 
144 aa  251  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2625  transposase  77.56 
 
 
158 aa  251  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0074  transposase  75.8 
 
 
157 aa  249  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.509194  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4725  transposase  56.05 
 
 
157 aa  177  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2900  transposase  56.05 
 
 
157 aa  177  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.020589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2996  transposase  56.05 
 
 
157 aa  177  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.277448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4009  transposase  56.05 
 
 
157 aa  177  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.275389  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4506  transposase  56.05 
 
 
157 aa  175  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30780  transposase  52.87 
 
 
157 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25480  transposase  52.87 
 
 
157 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13510  transposase  52.87 
 
 
157 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13600  transposase  52.87 
 
 
157 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16510  transposase  52.87 
 
 
157 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20700  transposase  52.87 
 
 
157 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41580  transposase  52.87 
 
 
157 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49710  transposase  52.87 
 
 
157 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24580  transposase  52.87 
 
 
157 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0063  hypothetical protein  79.38 
 
 
97 aa  152  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0966  transposase  42.55 
 
 
159 aa  103  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281851  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  41.83 
 
 
390 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  40.13 
 
 
375 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0630  hypothetical protein  39.19 
 
 
140 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0774  transposase  32.91 
 
 
163 aa  84.3  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2935  hypothetical protein  36.49 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4435  transposase  31.01 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4308  hypothetical protein  38.58 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0140244  normal  0.688879 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1012  transposase  33.11 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  30.58 
 
 
362 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  28.1 
 
 
356 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  28.1 
 
 
356 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  28.1 
 
 
356 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  29.27 
 
 
360 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28040  transposase  37.88 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  26.21 
 
 
366 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  34.12 
 
 
373 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8357  putative transposase  32.94 
 
 
356 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5437  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  26.97 
 
 
300 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218978  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2127  putative transposase  33.6 
 
 
224 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  25.5 
 
 
363 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  25.68 
 
 
346 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  25.66 
 
 
363 aa  41.2  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  25.2 
 
 
626 aa  40.8  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>