43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0539 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0539  transposase  100 
 
 		 157 aa  320  5e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1467  transposase  85.99 
 
 		 157 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1252  transposase  80.89 
 
 		 157 aa  259  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2625  transposase  73.38 
 
 		 158 aa  235  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0074  transposase  71.97 
 
 		 157 aa  233  7e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.509194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1478  transposase  80.43 
 
 		 144 aa  233  9e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24580  transposase  50.32 
 
 		 157 aa  167  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16510  transposase  50.32 
 
 		 157 aa  167  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13600  transposase  50.32 
 
 		 157 aa  167  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13510  transposase  50.32 
 
 		 157 aa  167  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20700  transposase  50.32 
 
 		 157 aa  167  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25480  transposase  50.32 
 
 		 157 aa  167  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30780  transposase  50.32 
 
 		 157 aa  167  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41580  transposase  50.32 
 
 		 157 aa  167  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49710  transposase  50.32 
 
 		 157 aa  167  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4009  transposase  50.32 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.275389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2996  transposase  50.32 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.277448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2900  transposase  50.32 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.020589 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4725  transposase  50.32 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4506  transposase  49.04 
 
 		 157 aa  153  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0063  hypothetical protein  76.29 
 
 		 97 aa  150  8e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0966  transposase  39.72 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0630  hypothetical protein  40.54 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  36.84 
 
 		 375 aa  87.4  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  39.46 
 
 		 390 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2935  hypothetical protein  35.14 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0774  transposase  31.21 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1012  transposase  33.58 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4435  transposase  29.94 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4308  hypothetical protein  33.86 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0140244  normal  0.688879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  29.51 
 
 		 362 aa  47.4  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  25.49 
 
 		 363 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  25 
 
 		 363 aa  44.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  28.57 
 
 		 361 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  28.57 
 
 		 361 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  25.17 
 
 		 626 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  25.32 
 
 		 363 aa  41.6  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  26.9 
 
 		 376 aa  41.2  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  25.32 
 
 		 363 aa  41.2  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  25.32 
 
 		 363 aa  41.2  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  25.32 
 
 		 363 aa  41.2  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28040  transposase  34.85 
 
 		 63 aa  41.2  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  25.32 
 
 		 363 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>