81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4435 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4435  transposase  100 
 
 
147 aa  295  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0774  transposase  74.15 
 
 
163 aa  226  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1012  transposase  34.75 
 
 
143 aa  90.1  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1467  transposase  32.48 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0074  transposase  32.9 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.509194  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2625  transposase  31.61 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1252  transposase  31.01 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0539  transposase  29.94 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  32.37 
 
 
390 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0966  transposase  36.84 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281851  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4009  transposase  31.45 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.275389  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2996  transposase  31.45 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.277448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2900  transposase  31.45 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.020589 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4725  transposase  31.45 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  33.61 
 
 
375 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4506  transposase  30.19 
 
 
157 aa  67  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0630  hypothetical protein  32.62 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30780  transposase  31.82 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49710  transposase  31.82 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25480  transposase  31.82 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24580  transposase  31.82 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20700  transposase  31.82 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16510  transposase  31.82 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13510  transposase  31.82 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41580  transposase  31.82 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13600  transposase  31.82 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  27.63 
 
 
377 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  28.19 
 
 
377 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  28.19 
 
 
377 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  28.19 
 
 
377 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  28.19 
 
 
377 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  28.19 
 
 
377 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  28.19 
 
 
377 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  28.19 
 
 
377 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  28.19 
 
 
377 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  28.19 
 
 
377 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  28.19 
 
 
377 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  28.19 
 
 
377 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1478  transposase  27.42 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  27.82 
 
 
366 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  32.37 
 
 
356 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  32.37 
 
 
356 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  32.37 
 
 
356 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  34.09 
 
 
364 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  27.27 
 
 
346 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2747  hypothetical protein  33.9 
 
 
373 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3014  hypothetical protein  34.62 
 
 
311 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  32.86 
 
 
391 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2935  hypothetical protein  27.4 
 
 
178 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4308  hypothetical protein  30.56 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0140244  normal  0.688879 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8357  putative transposase  40.68 
 
 
356 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5437  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  26.42 
 
 
300 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218978  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  30.95 
 
 
373 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  29.29 
 
 
376 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  29.63 
 
 
364 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  29.63 
 
 
364 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  29.63 
 
 
364 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  29.63 
 
 
364 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  29.63 
 
 
364 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  29.63 
 
 
364 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  29.63 
 
 
364 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  29.63 
 
 
364 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  29.63 
 
 
364 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  28.83 
 
 
363 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  28.83 
 
 
363 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  28.83 
 
 
363 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  27.08 
 
 
363 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  27.08 
 
 
363 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  27.08 
 
 
363 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  25.56 
 
 
370 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  25.56 
 
 
370 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1354  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
295 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  25.56 
 
 
367 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  25.56 
 
 
367 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  25.56 
 
 
370 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  30.5 
 
 
357 aa  40.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  30.5 
 
 
357 aa  40.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  30.5 
 
 
357 aa  40.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  30.5 
 
 
357 aa  40.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  30.5 
 
 
357 aa  40.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  26.87 
 
 
359 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>