43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2935 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2935  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  350  5e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2625  transposase  39.22 
 
 		 158 aa  95.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0074  transposase  40 
 
 		 157 aa  91.3  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.509194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1252  transposase  36.49 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0539  transposase  35.14 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1467  transposase  36.49 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4725  transposase  35.81 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2900  transposase  35.81 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.020589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2996  transposase  35.81 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.277448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4009  transposase  35.81 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.275389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25480  transposase  32.64 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13510  transposase  32.64 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13600  transposase  32.64 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16510  transposase  32.64 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20700  transposase  32.64 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24580  transposase  32.64 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30780  transposase  32.64 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41580  transposase  32.64 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49710  transposase  32.64 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1478  transposase  35.25 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4506  transposase  32.64 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0966  transposase  31.76 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0630  hypothetical protein  30.57 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  31.43 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  29.29 
 
 		 375 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0774  transposase  26.42 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4435  transposase  27.4 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4308  hypothetical protein  35.29 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0140244  normal  0.688879 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0063  hypothetical protein  41.27 
 
 		 97 aa  43.9  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  32.76 
 
 		 363 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  25.85 
 
 		 346 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  31.94 
 
 		 391 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02112  isrso5-transposase protein  28.93 
 
 		 333 aa  42  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  31.9 
 
 		 363 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1012  transposase  30.88 
 
 		 143 aa  41.6  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  31.9 
 
 		 363 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  31.9 
 
 		 363 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  31.9 
 
 		 363 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  31.9 
 
 		 363 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  28.93 
 
 		 242 aa  41.6  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  31.9 
 
 		 363 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04270  isrso5-transposase protein  28.93 
 
 		 243 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4771  putative transposase  31.9 
 
 		 282 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>