209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0630 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0630  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0966  transposase  41.86 
 
 
159 aa  100  9e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281851  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0539  transposase  40.54 
 
 
157 aa  92  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2625  transposase  39.19 
 
 
158 aa  89.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1252  transposase  39.19 
 
 
157 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1467  transposase  38.16 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4725  transposase  36.77 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2900  transposase  36.77 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.020589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2996  transposase  36.77 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.277448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4009  transposase  36.77 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.275389  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0074  transposase  34.46 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.509194  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0774  transposase  35.46 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1012  transposase  36.3 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1478  transposase  34.31 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13510  transposase  33.78 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13600  transposase  33.78 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20700  transposase  33.78 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16510  transposase  33.78 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25480  transposase  33.78 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41580  transposase  33.78 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30780  transposase  33.78 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24580  transposase  33.78 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49710  transposase  33.78 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4506  transposase  32.9 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  33.08 
 
 
376 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4435  transposase  32.62 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  32.33 
 
 
346 aa  63.5  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02112  isrso5-transposase protein  29.84 
 
 
333 aa  62  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  34.11 
 
 
390 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  34.23 
 
 
355 aa  60.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  29.03 
 
 
242 aa  60.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  33.09 
 
 
387 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  33.09 
 
 
387 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  33.09 
 
 
387 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  32.61 
 
 
375 aa  60.1  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  32.74 
 
 
346 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04270  isrso5-transposase protein  29.03 
 
 
243 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  32.59 
 
 
357 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  32.59 
 
 
357 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  32.59 
 
 
357 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  32.59 
 
 
357 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  32.59 
 
 
357 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  31.48 
 
 
354 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2935  hypothetical protein  30.57 
 
 
178 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  34.09 
 
 
391 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1872  IS630 family transposase  36.79 
 
 
376 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.226445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  36.79 
 
 
365 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  29.46 
 
 
362 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  29.46 
 
 
362 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  29.2 
 
 
363 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  29.2 
 
 
363 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  29.2 
 
 
363 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4771  putative transposase  29.2 
 
 
282 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451842  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  29.2 
 
 
363 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  29.2 
 
 
363 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  29.2 
 
 
363 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  30.36 
 
 
362 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  29.2 
 
 
363 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  32.59 
 
 
356 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  30.37 
 
 
370 aa  53.9  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  27.93 
 
 
360 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  29.63 
 
 
356 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  29.63 
 
 
356 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  29.1 
 
 
365 aa  53.9  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  30.08 
 
 
356 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  30.08 
 
 
356 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  30.08 
 
 
356 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0063  hypothetical protein  55.81 
 
 
97 aa  53.5  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  32.73 
 
 
362 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  32.73 
 
 
362 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  32.73 
 
 
362 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  32.73 
 
 
340 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  32.73 
 
 
362 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  38.46 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  38.46 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  28.07 
 
 
363 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  28.07 
 
 
363 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  28.07 
 
 
363 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  33.63 
 
 
361 aa  50.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  33.63 
 
 
361 aa  50.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  29.2 
 
 
363 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  27.69 
 
 
366 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0723  Integrase catalytic region  30.59 
 
 
327 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0725  Transposase-like protein  30.59 
 
 
327 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.234146  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2203  Integrase catalytic region  30.59 
 
 
327 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0140131  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0211  ISSod10, transposase OrfA  37.33 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4308  hypothetical protein  36.46 
 
 
125 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0140244  normal  0.688879 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  30.71 
 
 
377 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  31.3 
 
 
377 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  31.3 
 
 
377 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  28.03 
 
 
364 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  31.3 
 
 
377 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  30.71 
 
 
377 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  31.3 
 
 
377 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  31.3 
 
 
377 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  31.3 
 
 
377 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  31.3 
 
 
377 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  31.3 
 
 
377 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  31.3 
 
 
377 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  28.95 
 
 
363 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>