53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1478 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1478  transposase  100 
 
 
144 aa  296  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1252  transposase  86.23 
 
 
157 aa  251  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1467  transposase  85.51 
 
 
157 aa  249  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0539  transposase  80.43 
 
 
157 aa  233  8e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2625  transposase  79.71 
 
 
158 aa  227  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0074  transposase  75.36 
 
 
157 aa  217  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.509194  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0063  hypothetical protein  84.42 
 
 
97 aa  141  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16510  transposase  48.55 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49710  transposase  48.55 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41580  transposase  48.55 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13510  transposase  48.55 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13600  transposase  48.55 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20700  transposase  48.55 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24580  transposase  48.55 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25480  transposase  48.55 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30780  transposase  48.55 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4009  transposase  48.55 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.275389  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2996  transposase  48.55 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.277448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2900  transposase  48.55 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.020589 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4725  transposase  48.55 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4506  transposase  46.38 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0966  transposase  35.82 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  38.97 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0630  hypothetical protein  34.31 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  36.03 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2935  hypothetical protein  35.25 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4308  hypothetical protein  37.38 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0140244  normal  0.688879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  29.75 
 
 
362 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4435  transposase  27.42 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0774  transposase  22.38 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  30.89 
 
 
363 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1012  transposase  30 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  30.08 
 
 
363 aa  47.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  30.08 
 
 
363 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  30.08 
 
 
363 aa  47  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  30.08 
 
 
363 aa  47  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  30.08 
 
 
363 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  28.35 
 
 
363 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  28.1 
 
 
356 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  29.75 
 
 
361 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  29.75 
 
 
361 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  27.56 
 
 
626 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  26.72 
 
 
366 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8357  putative transposase  33.33 
 
 
356 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  31.33 
 
 
373 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  31.03 
 
 
374 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  28.12 
 
 
363 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  28.12 
 
 
363 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  28.12 
 
 
363 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  26.23 
 
 
365 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  26.89 
 
 
355 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  25.74 
 
 
366 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28040  transposase  36.36 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>