53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1467 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1467  transposase  100 
 
 		 157 aa  324  4.0000000000000003e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0539  transposase  85.99 
 
 		 157 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1252  transposase  82.17 
 
 		 157 aa  269  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1478  transposase  85.51 
 
 		 144 aa  249  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0074  transposase  73.89 
 
 		 157 aa  246  9e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.509194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2625  transposase  74.03 
 
 		 158 aa  241  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4725  transposase  53.5 
 
 		 157 aa  174  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2900  transposase  53.5 
 
 		 157 aa  174  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.020589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2996  transposase  53.5 
 
 		 157 aa  174  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.277448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4009  transposase  53.5 
 
 		 157 aa  174  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.275389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20700  transposase  51.59 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13510  transposase  51.59 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13600  transposase  51.59 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16510  transposase  51.59 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24580  transposase  51.59 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25480  transposase  51.59 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30780  transposase  51.59 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41580  transposase  51.59 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49710  transposase  51.59 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4506  transposase  51.59 
 
 		 157 aa  164  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0063  hypothetical protein  81.44 
 
 		 97 aa  158  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0966  transposase  39.72 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  38.82 
 
 		 375 aa  90.9  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0630  hypothetical protein  38.16 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  36.84 
 
 		 390 aa  87  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0774  transposase  31.21 
 
 		 163 aa  84  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4435  transposase  32.48 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2935  hypothetical protein  36.49 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1012  transposase  31.08 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4308  hypothetical protein  37.04 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0140244  normal  0.688879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  26.49 
 
 		 362 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  28 
 
 		 363 aa  47.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  25.17 
 
 		 364 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  26.32 
 
 		 361 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  26.32 
 
 		 361 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  27.45 
 
 		 376 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  25 
 
 		 356 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  25.64 
 
 		 363 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  25.81 
 
 		 626 aa  44.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  26.28 
 
 		 391 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  27.81 
 
 		 363 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  27.27 
 
 		 363 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  27.81 
 
 		 363 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  27.81 
 
 		 363 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  27.81 
 
 		 363 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1872  IS630 family transposase  31.82 
 
 		 376 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.226445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  31.82 
 
 		 365 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  27.4 
 
 		 374 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  25.68 
 
 		 366 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28040  transposase  34.85 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  24.36 
 
 		 363 aa  40.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  24.36 
 
 		 363 aa  40.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  24.36 
 
 		 363 aa  40.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>