259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4771 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4771  putative transposase  100 
 
 
282 aa  574  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451842  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  99.61 
 
 
363 aa  520  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  99.61 
 
 
363 aa  520  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  99.61 
 
 
363 aa  520  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  99.61 
 
 
363 aa  520  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  99.61 
 
 
363 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  99.61 
 
 
363 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  99.22 
 
 
363 aa  518  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3419  putative transposase  94.29 
 
 
211 aa  407  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.963439  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  98.94 
 
 
583 aa  384  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  51.95 
 
 
364 aa  255  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  44.71 
 
 
357 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  44.71 
 
 
357 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  44.71 
 
 
357 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  44.71 
 
 
357 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  44.71 
 
 
357 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  45.31 
 
 
366 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  44.72 
 
 
359 aa  189  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  42.57 
 
 
364 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  46.03 
 
 
370 aa  188  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  41.34 
 
 
365 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  43.37 
 
 
364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  43.37 
 
 
364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  43.37 
 
 
364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  43.37 
 
 
364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  43.37 
 
 
364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  43.37 
 
 
364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  43.37 
 
 
364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  43.37 
 
 
364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  43.37 
 
 
364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  41.18 
 
 
366 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  46.55 
 
 
373 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  40.16 
 
 
355 aa  178  9e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  41.25 
 
 
361 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  41.25 
 
 
361 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5437  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  43.44 
 
 
300 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218978  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  43.67 
 
 
374 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  41.13 
 
 
362 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  42.11 
 
 
356 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  41.13 
 
 
362 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  41.13 
 
 
362 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  41.13 
 
 
362 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  39.59 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  40.47 
 
 
367 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  41.15 
 
 
362 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  40.73 
 
 
340 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  41.56 
 
 
363 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8357  putative transposase  44.74 
 
 
356 aa  171  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  40.08 
 
 
370 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  40.16 
 
 
363 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  40.08 
 
 
367 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  40.16 
 
 
363 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  40.08 
 
 
370 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  40.08 
 
 
370 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  40.16 
 
 
363 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  40.16 
 
 
363 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  40.16 
 
 
363 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  40.16 
 
 
363 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  37.86 
 
 
346 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02112  isrso5-transposase protein  41.13 
 
 
333 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  38.19 
 
 
364 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  37.14 
 
 
362 aa  165  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  37.14 
 
 
362 aa  165  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  41.28 
 
 
375 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0513  transposase  42.73 
 
 
287 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  40.47 
 
 
379 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  39.51 
 
 
363 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  39.51 
 
 
363 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  39.51 
 
 
363 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  38.78 
 
 
360 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  38.78 
 
 
363 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  36.89 
 
 
361 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  36.89 
 
 
361 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2523  putative transposase  36.33 
 
 
285 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  36.89 
 
 
361 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  36.33 
 
 
351 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04270  isrso5-transposase protein  41.18 
 
 
243 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  39.09 
 
 
366 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  36.33 
 
 
351 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  38.98 
 
 
362 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  38.98 
 
 
362 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  38.98 
 
 
389 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  38.98 
 
 
362 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  40.76 
 
 
242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  40.97 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  40.97 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  40.97 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  40.97 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  40.97 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  40.97 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  40.97 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  40.97 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  40.97 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  40.97 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  40.97 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  40.97 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  40.97 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  40.97 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  40.97 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  42.65 
 
 
363 aa  152  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>