220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3419 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3419  putative transposase  100 
 
 
211 aa  428  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.963439  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  94.76 
 
 
363 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  94.76 
 
 
363 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  94.76 
 
 
363 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  94.76 
 
 
363 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  94.76 
 
 
363 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  94.76 
 
 
363 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  94.76 
 
 
363 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4771  putative transposase  94.29 
 
 
282 aa  407  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451842  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  93.96 
 
 
583 aa  351  4e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  57.14 
 
 
364 aa  229  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  47.85 
 
 
357 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  47.85 
 
 
357 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  47.85 
 
 
357 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  47.85 
 
 
357 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  47.85 
 
 
357 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  49.26 
 
 
366 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  48.02 
 
 
359 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  45.24 
 
 
364 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  45.24 
 
 
370 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  46.31 
 
 
364 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  46.31 
 
 
364 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  46.31 
 
 
364 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  46.31 
 
 
364 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  46.31 
 
 
364 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  46.31 
 
 
364 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  46.31 
 
 
364 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  46.31 
 
 
364 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  46.31 
 
 
364 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5437  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  47.78 
 
 
300 aa  170  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218978  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  47.06 
 
 
373 aa  165  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  42.08 
 
 
355 aa  164  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  43.07 
 
 
365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  45.77 
 
 
361 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  45.77 
 
 
361 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  45.54 
 
 
356 aa  162  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  45.77 
 
 
374 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8357  putative transposase  46.08 
 
 
356 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  43.13 
 
 
367 aa  158  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  42 
 
 
362 aa  158  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  43.35 
 
 
366 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  42.57 
 
 
362 aa  158  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  44.28 
 
 
362 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  43.78 
 
 
363 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  44.28 
 
 
362 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  44.28 
 
 
362 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  44.28 
 
 
362 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  42.65 
 
 
370 aa  156  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  42.65 
 
 
370 aa  155  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  42.65 
 
 
370 aa  155  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  42.65 
 
 
367 aa  155  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  43.78 
 
 
340 aa  154  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02112  isrso5-transposase protein  45.5 
 
 
333 aa  154  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  43.28 
 
 
363 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  43.28 
 
 
363 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  43.28 
 
 
363 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  43.28 
 
 
363 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  43.28 
 
 
363 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  43.28 
 
 
363 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  43.28 
 
 
363 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  43.28 
 
 
363 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  40.3 
 
 
346 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  41.09 
 
 
363 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  41.09 
 
 
363 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  41.09 
 
 
363 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  43.5 
 
 
375 aa  152  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  41.09 
 
 
363 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  40.59 
 
 
362 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  40.59 
 
 
362 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  41.09 
 
 
363 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  41.09 
 
 
363 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  42.5 
 
 
363 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  42.5 
 
 
363 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  42.5 
 
 
363 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  42.86 
 
 
360 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  42.5 
 
 
363 aa  148  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 
359 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 
359 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 
359 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 
359 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 
359 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 
359 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 
359 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 
359 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 
359 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 
359 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 
359 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 
359 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 
359 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 
359 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 
359 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  41.38 
 
 
366 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0513  transposase  43.07 
 
 
287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  42.5 
 
 
363 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04270  isrso5-transposase protein  45.41 
 
 
243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  42.5 
 
 
362 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  47.31 
 
 
379 aa  145  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  42.5 
 
 
362 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  42.5 
 
 
362 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  42.5 
 
 
389 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>