143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2747 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2747  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  759    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  34.15 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  34.15 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  34.15 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  34.15 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  34.15 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  34.15 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  34.15 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  34.15 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  33.88 
 
 		 377 aa  223  6e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  33.88 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  33.6 
 
 		 377 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  34.58 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  24.05 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  25.81 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  25.81 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  25.81 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  24.32 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  24.86 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  24.86 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  23.35 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  23.35 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  23.35 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  22.99 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  26.51 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  26.51 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  22.4 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  22.68 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  22.4 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  24.71 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  24.71 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  22.4 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  22.4 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  24.64 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  24.71 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  22.4 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  21.33 
 
 		 361 aa  57  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  21.33 
 
 		 361 aa  57  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  23.22 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  22.4 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4435  transposase  34.38 
 
 		 147 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  23.39 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  23.39 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  23.39 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  23.39 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  22.47 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1872  IS630 family transposase  22.94 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.226445 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5437  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  23.1 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  22.94 
 
 		 365 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  20.66 
 
 		 359 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  23.35 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  23.35 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  23.35 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  23.12 
 
 		 340 aa  52.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  23.78 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  22.44 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  22.44 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  21.08 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  22.93 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  21.08 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  21.08 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  22.4 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  21.08 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  22.4 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  21.76 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  21.88 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  21.08 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  24.75 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  21.69 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  21.69 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  21.69 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  23.71 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  22.4 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  22.4 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  22.4 
 
 		 363 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  23.03 
 
 		 391 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  23.88 
 
 		 362 aa  50.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  23.88 
 
 		 362 aa  50.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  23.88 
 
 		 362 aa  50.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  23.88 
 
 		 362 aa  50.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  23.88 
 
 		 362 aa  50.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  23.88 
 
 		 362 aa  50.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  22.8 
 
 		 373 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.72 
 
 		 350 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.72 
 
 		 350 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>