91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2127 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2127  putative transposase  100 
 
 		 224 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3263  hypothetical protein  74.23 
 
 		 376 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1237  putative transposase  76.83 
 
 		 172 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9055  hypothetical protein  61.34 
 
 		 373 aa  237  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3961  putative transposase  37.5 
 
 		 341 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4365  hypothetical protein  42.28 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2959  hypothetical protein  33.78 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  35.43 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  35.43 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  35.43 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  27.72 
 
 		 355 aa  55.1  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  28.57 
 
 		 357 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  22.94 
 
 		 377 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  28.57 
 
 		 357 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  28.57 
 
 		 357 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  28.57 
 
 		 357 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  22.94 
 
 		 377 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  22.94 
 
 		 377 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  22.94 
 
 		 377 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  23.33 
 
 		 377 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  22.94 
 
 		 377 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  22.94 
 
 		 377 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  22.94 
 
 		 377 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  22.94 
 
 		 377 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  22.94 
 
 		 377 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  28.57 
 
 		 357 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  22.94 
 
 		 377 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4771  putative transposase  28.57 
 
 		 282 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  28.57 
 
 		 363 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  28.57 
 
 		 363 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  28.57 
 
 		 363 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  28.57 
 
 		 363 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  28.57 
 
 		 363 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  28.57 
 
 		 363 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  28.57 
 
 		 363 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0520  hypothetical protein  29.48 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  22.35 
 
 		 377 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1919  hypothetical protein  29.48 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2625  transposase  34.04 
 
 		 158 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0239  putative transposase  28.66 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3067  IS630 family transposase  31.03 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1258  IS630 family transposase  31.03 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5033  putative transposase  28.66 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0700761  normal  0.0166306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6643  putative transposase  28.66 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2033  putative transposase  28.66 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  30.98 
 
 		 362 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  29.38 
 
 		 366 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5771  hypothetical protein  35.87 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  30.51 
 
 		 365 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3129  transposase of IS653-like element  27.71 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0074  transposase  30.46 
 
 		 157 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.509194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  27.54 
 
 		 355 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  27.54 
 
 		 355 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  27.54 
 
 		 355 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  34.38 
 
 		 375 aa  46.6  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  28.11 
 
 		 340 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  28.11 
 
 		 362 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  28.11 
 
 		 362 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  28.11 
 
 		 362 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  28.11 
 
 		 362 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  27.57 
 
 		 370 aa  45.4  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  27.57 
 
 		 370 aa  45.4  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  28.49 
 
 		 363 aa  45.1  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  28.49 
 
 		 362 aa  45.1  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  28.49 
 
 		 362 aa  45.1  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04270  isrso5-transposase protein  31.4 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  31.4 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  27.57 
 
 		 367 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  28.49 
 
 		 363 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  28.49 
 
 		 363 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  28.49 
 
 		 363 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  27.57 
 
 		 370 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  34.78 
 
 		 356 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  34.78 
 
 		 356 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  28.49 
 
 		 363 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  34.78 
 
 		 356 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  27.33 
 
 		 346 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4058  transposase and inactivated derivative  32.63 
 
 		 169 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.407481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  27.03 
 
 		 367 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  34.45 
 
 		 363 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  29.44 
 
 		 363 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3419  putative transposase  31.09 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.963439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  33.33 
 
 		 363 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  33.33 
 
 		 363 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  28.09 
 
 		 363 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  30.43 
 
 		 391 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  33.33 
 
 		 363 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1252  transposase  33.6 
 
 		 157 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1886  hypothetical protein  23.29 
 
 		 165 aa  42.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5772  hypothetical protein  41.07 
 
 		 61 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02112  isrso5-transposase protein  31.4 
 
 		 333 aa  42.4  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>