58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3067 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1258  IS630 family transposase  100 
 
 		 180 aa  362  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3067  IS630 family transposase  100 
 
 		 180 aa  362  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0520  hypothetical protein  99.44 
 
 		 220 aa  360  6e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1919  hypothetical protein  99.44 
 
 		 217 aa  358  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9055  hypothetical protein  34.34 
 
 		 373 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3961  putative transposase  33.09 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2127  putative transposase  31.03 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3263  hypothetical protein  29.45 
 
 		 376 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1237  putative transposase  27.93 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0769  IS630 family transposase  29.45 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.19 
 
 		 350 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  26.85 
 
 		 343 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0727  hypothetical protein  28.15 
 
 		 199 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.172547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4365  hypothetical protein  34.41 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  26.85 
 
 		 343 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.82 
 
 		 350 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.82 
 
 		 350 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.82 
 
 		 350 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.82 
 
 		 350 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.82 
 
 		 350 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.82 
 
 		 350 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.82 
 
 		 350 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.82 
 
 		 350 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.82 
 
 		 350 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  26.95 
 
 		 343 aa  45.1  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.82 
 
 		 349 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.82 
 
 		 350 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.82 
 
 		 350 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.47 
 
 		 350 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.47 
 
 		 350 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.47 
 
 		 350 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.82 
 
 		 350 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.82 
 
 		 350 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.47 
 
 		 350 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  31.9 
 
 		 363 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4771  putative transposase  31.9 
 
 		 282 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2910  hypothetical protein  28.19 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2959  hypothetical protein  27.61 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  31.9 
 
 		 363 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  28.81 
 
 		 355 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  28.18 
 
 		 376 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2787  hypothetical protein  30.18 
 
 		 387 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  27.87 
 
 		 391 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  31.9 
 
 		 363 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  31.9 
 
 		 363 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  31.9 
 
 		 363 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  31.9 
 
 		 363 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  31.9 
 
 		 363 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0239  putative transposase  27.01 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4384  hypothetical protein  29.91 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6643  putative transposase  27.01 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5033  putative transposase  27.01 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0700761  normal  0.0166306 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  28.57 
 
 		 363 aa  42  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3425  hypothetical protein  29.79 
 
 		 199 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.07 
 
 		 350 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2679  hypothetical protein  29.79 
 
 		 199 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  28.65 
 
 		 362 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  28.65 
 
 		 362 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>